Trùng giày có cấu tạo và lối sống phức tạp nhưng vẫn là động vật đơn bào. Lớp màng bọc ngoài cơ thể là lớp màng phin trong suốt như ở trùng roi, giúp cơ thể chúng có hình dạng nhất định. Bao phủ toàn bộ cơ thể là lông bơi xếp thành dãy giúp trùng giày bơi trong nước