Trong công nghiệp thực phẩm, nước hầu như hiện diện trong hầu hết các quá trình công nghệ. Cụ thể nước có thể có các vai trò sau: Nguyên liệu chế biến: thường sử dụng là loại nước đạt tiêu chuẩn cho ăn uống. Tham gia vào các quá trình vận chuyển, xử lý nguyên liệu và sử dụng trong lò hơi: thường sử dụng các loại nước đạt tiêu chuẩn dùng cho sinh hoạt. | Sự tồn tại của các vi khuẩn không có nguồn gốc từ phân trong định nghĩa vi khuẩn "coliforms" và "coliforms không lên men đường lactose" làm hạn chế khả năng thích hợp của nhóm này cho việc chỉ điểm ô nhiễm phân. Nước sau khi xử lý không được có coliforms, nếu có thì có thể nghĩ đến quá trình xử lý không đảm bảo, sự tái ô nhiễm sau xử lý hoặc nước có nhiều chất dinh dưỡng cho vi sinh vật. Vì vậy có thể dùng xét nghiệm coliforms để đánh giá hiệu quả xử lý lẫn tính chất toàn vẹn của hệ thống phân phối. Tuy rằng không phải lúc nào coliforms cũng liên quan hoặc trực tiếp đến sự hiện diện của ô nhiễm phân hay vi khuẩn gây bệnh trong nước uống. Coliforms vẫn tiếp tục được sử dụng để theo dõi chất lượng vi sinh vật của nước máy sau khi xử lý. Trong trường hợp có nghi vấn, nhất là khi tìm thấy coliforms trong nước không có coliforms chịu nhiệt và thì phải tiến hành phân lập các vi sinh vật chỉ điểm khác hoặc xác định đậm độ của chúng để điều tra bản chất của sự ô nhiễm. Ngoài ra, cũng cần thiết phải tiến hành thanh tra vệ sinh.
