Ngày nay những lợi ích của nấm đã được ứng dụng rất rộng rãi trong nhiều lĩnh vực của đời sống lẫn sản xuất, nhiều loài được sử dụng trong lĩnh vực công nghệ sinh học, công nghệ thực phẩm, sử dụng làm thức ăn hoặc trong quá trình lên men. Nấm còn được dùng để sản xuất chất kháng sinh (penicillin, griseofulvin), hoóc môn, các vitamin (nhóm B, riboflavin), acid hữu cơ (acid oxalic, citric, gluconic.) và nhiều loại enzym. Tuy vậy, bên cạnh những lợi ích ấy, thì nấm cũng là nguyên nhân gây tổn thất mùa màng,.