Ubuntu mặc định không sử dụng một phân vùng chủ riêng biệt, mặc dù nhiều người dùng Linux thích điều dụng một phân vùng chủ tách riêng cho phép bạn cài lại Ubuntu mà không làm mất các tệp tin và thiết lập cá nhân. Trong khi một phân vùng chủ thường được chọn trong quá trình cài đặt, bạn cũng có thể chuyển phân vùng chủ sau khi cài Ubuntu.