Thực hiện quyền công tố và kiểm sát việc tuân theo pháp luật trong tố tụng hình sự của Viện kiểm sát Toà án nhân dân tối cao vẫn phải xử phúc thẩm cho các bản án bị kháng nghị, kháng cáo của 63 tỉnh, thành và tỉ lệ án tồn đọng vẫn khá cao. Tính độc lập của các thẩm phán vẫn chưa được đảm bảo do nhiệm kì bổ nhiệm của thẩm phán chỉ có 5 năm và hết nhiệm kì đó thẩm phán phải được Chánh án Toà án nhân dân tối cao bổ nhiệm lại theo.