Các chỉ tiêu tài chính của Công ty khá lành mạnh và bền vững. Khoản vay ngắn hạn chủ yếu được tài trợ cho hàng tồn kho và vùng nuôi gần 700 ha của Công ty. Mặc dù là doanh nghiệp hàng đầu của tỉnh Sóc Trăng về kim ngạch xuất khẩu tôm và có hoạt động sản xuất kinh doanh tăng trưởng ổn định, nhưng các chỉ số hoạt động của Stapimex vẫn chưa cao so với các doanh nghiệp cùng ngành do giá thu mua nguyên liệu cao, sản phẩm của Công ty còn mang tính truyền thống, chưa có bước đột phá.