Do sản lượng lươn thu được từ sinh sản nhân tạo còn khiêm tốn nên đa phần lươn thả nuôi hiện nay đều có nguồn gốc từ tự nhiên. Lươn tuy có sức chịu đựng tốt, nhưng do điều kiện bể nuôi có nhiều điểm khác biệt so với môi trường tự nhiên nên sức đề kháng của lươn phần nào giảm sút. Nguyên nhân là do quá trình đánh bắt gây chấn động mạnh, thời gian dự trữ nhiều ngày không cho ăn làm lươn bị đói. Trong quá trình nuôi, sự thay đổi đột ngột của thời tiết,.