Các chức năng phân tích không gian cuả hệ GIS phân biệt hệ GIS so với các hệ thông tin khác. - Bản đồ giấy: thông tin địa lý được tổ chức như là một tập hợp các lớp (đường, sông suối, thực phủ, ranh giới hành chính). mỗi lớp được vẽ riêng trong quá trình sản xuất bản đồ. - Hệ GIS: lưu trữ và hiển thị thông tin hoàn toàn tách biệt, Mức độ chi tiết của thông tin được lưu trữ bị giới hạn bởi khả năng lưu trữ phần cứng và phương pháp mà phần mềm.