Hiện nay, mặc dù các doanh nghiệp chăn nuôi heo đã có nhiều cố gắng đổi mới khoa học công nghệ, nâng cao chất lượng sản phẩm và đặc biệt là sự đầu tư tìm kiếm thị trường mới, nhưng nếu xét trên góc độ tổng thể của ngành thì nhìn chung còn nhiều vấn đề bất cập, thiếu sự phối hợp giữa các doanh nghiệp với nhau, cơ chế quản lý và việc phân cấp quản lý còn yếu.