Microsoft cung cấp hai sản phẩm giúp tích hợp một số ứng dụng đang tồn tại: - BizTalk Server cho sự tích hợp ứng dụng, quản lý quá trình trong doanh nghiệp và vấn đề thương mại giữa các doanh nghiệp. - Host Integration Server cho tích hợp và cấu hình bảo mật tin cậy cho người dùng với IBM zSeries mainframe, các ứng dụng host tầm trung bình iSeries và các cơ sở dữ liệu IBM DB2.