Cùng với sự phát triển kinh tế xã hội thì các nguồn thải sinh hoạt, công nghiệp, chất thải rắn đô thị, công nghiệp và chất thải nguy hại đã và đang đe dọa nghiêm trọng về khả năng ô nhiễm nguồn nước sông. Do đó công tác quan trắc môi trường nước lưu vực sông Đồng Nai – Sài Gòn cần thiết phải được thực hiện liên tục, nhằm đánh giá một cách chính xác hiện trạng, theo dõi diễn biến chất lượng môi trường nước. | Các hóa chất bảo vệ thực vật dù được sử dụng rộng rãi trong nông nghiệp, nhưng vẫn thuộc về một trong số các chất độc nhất đối với môi trường. Đặc biệt, các hóa chất trừ sâu gốc Clo có độc tính rất cao, tuy đã bị cấm sử dụng ở nhiều nước từ nhiều năm qua, vẫn được sử dụng lén lút ở Việt nam và một phần lý do là độc tính cao của các hợp chất này cho hiệu quả diệt trừ sâu bệnh nhanh chóng nên lại được nông dân ưa sử dụng. Các thuốc trừ sâu gốc Clo có độ độc hại cao nhất phải kể đến DDT, Lindan, Endrin,.Thời gian tồn trữ của chúng trong môi trường có khi kéo dài hàng năm nên rất nguy hiểm. Các bệnh gây ra bởi thuốc trừ sâu đã được nghiên cứu kỹ lưỡng, bao gồm ung thư, dị dạng, tê liệt thần kinh, làm rối loạn chức năng một số cơ quan,. Hiện nay, các thuốc trừ sâu gốc Phospho có xu hướng được sử dụng nhiều hơn. Chỳng cú độc tính thấp hơn các hợp chất gốc Clo nhưng quan trọng hơn là ở ngoài môi trường, chúng tương đối dễ dàng bị phân hủy tạo ra các sản phẩm ít độc hại hơn. Tuy nhiên, một số chất thuộc về nhóm này vẫn có độc tính rất cao như Methyl Parathion. Hiện nay, chất này đã bị cấm sử dụng ở nhiều nước.
