Nguyên nhân biến động cửa Thuận An và Tư Hiền là sự tác động tương tác giữa hoạt động của sóng biển cùng với dòng xung tích tương ứng và hoạt động của dòng chảy sông ngòi. Những biến động đột biến của chúng thường xuất hiện khi có hoạt động của bão và lũ lớn. Ngoài ra, những tác động của con người không tính đến cân bằng động lực đới bờ cũng làm tăng quá trình biến động các cử. nội dung bài viết "Nguyên nhân và giải pháp hạn chế sự biến động cửa đầm phá Tam Giang, Cầu Hai" để hiểu hơn về vấn đề này.
