Vấn đề xử lý amoni trong nước cấp ở mức nồng độ cao cỡ 10 - 25mg/lit là một trong những vấn đề cấp thiết ở nước ta và trên thế giới. Việc xử lý phải đòi hỏi phải tiến hành đồng thời hai quá trình nitrat hóa và khử nitrat hóa. Cả hai quá trình này đều tạo thành nitrit rất độc ở các bước chuyển hóa trung gian. Tỉ lệ giữa cơ chất hữu cơ và nito - nitrat là một thông số quan trọng ảnh hưởng trực tiếp tới quá trình này. Nếu tỷ lệ này thấp hiệu suất khử nitrat sẽ thấp, nhưng nếu quá cao có thể dẫn đến dư thừa thành phần hữu cơ gây nên ô nhiễm thứ cấp. Vì vậy cần nghiên cứu tỷ lệ này khi ứng dụng phương pháp lọc sinh học để xử lý amoni trong nước ngầm.