Nghiên cứu xây dựng quy trình giải trình tự vùng HVI, HVII của DNA ty thể người. Phân loại và đánh giá mẫu theo hai tiêu chí khối lượng và chất lượng. | TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC VĂN LANG Trƣơng Thế Quang GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG HVI, HVII CỦA DNA TY THỂ NGƢỜI HVI, HVII SEQUENCING OF HUMAN MITOCHONDRIAL DNA TRƯƠNG THẾ QUANG TÓM TẮT: Nghiên cứu xây dựng quy trình giải trình tự vùng HVI, HVII của DNA ty thể người. Phân loại và đánh giá mẫu theo hai tiêu chí khối lượng và chất lượng. Xây dựng đường chuẩn Singleplex Real - Time PCR để nhân bản và định lượng DNA đích, xác định được giá trị Ct cũng như Tm cho các vùng HVI, HVII đảm bảo cho quá trình giải trình tự thành công. Tiêu chuẩn để quá trình giải trình tự vùng HVI thành công là Ct = 33, Tm = 80 ÷ 83 0C; Tiêu chuẩn để quá trình giải trình tự vùng HVII thành công là Ct = 30, Tm = 83 ÷ 85 0C. Giải trình tự các vùng HVI và HVII hoàn chỉnh cho 10/14 mẫu chiếm tỷ lệ 52,63%. Đặc biệt, cũng giải trình tự thành công cho 5 mẫu xương bị thoái hóa nặng ở nhóm 3, là nhóm không đạt cả hai tiêu chí khối lượng và chất lượng. Ở trình tự HVI, có sự xuất hiện chuỗi homopoly C (≥ 8C) ít hơn trình tự HVII khoảng 5 lần, do đó nhất thiết phải giải trình tự hai chiều. Từ khóa: giải trình tự, HVI, HVII, DNA ty thể. ABSTRACT: Research about HVI, HVII sequencing process of human mitochondrial DNA. Classify and evaluate samples according to both mass and quality criteria. Construct Singleplex Real-Time PCR calibration curve to both duplicate and quantify the target DNA and determine Ct as well as Tm values for HVI and HVII regions to ensure successful sequencing. The standard for successful HVI sequencing is Ct = 33, Tm = 80 ÷ 83 0C; The standard for successful HVII sequencing is Ct = 30, Tm = 83 ÷ 85 0C. HVI and HVII regions were sequenced in 10 out of 14 samples, accounting for %. In particular, the successful sequencing of 5 severely deformed bone samples in Group 3 was not achieved in both mass and quality criteria. In the HVI sequence there appears a homopoly string C (≥ 8C) less than the HVII sequence of about 5, so it is necessary to twodimensional sequence. Key words: .
