Mục tiêu nghiên cứu bài viết nhằm xác định vật chủ sản xuất hợp chất tự nhiên onnamide từ Theonella swinhoei căn cứ trên kết quả phân tích gen ftsZ. Phương pháp: khuếch đại gen ftsZ từ ADN toàn phần của T. swinhoei bằng cặp mồi đặc hiệu, giải trình tự và phân tích bằng chương trình BLAST và BioEdit - ClustalW. | TẠP CHÍ Y - DƢỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 4-2016 PHÂN TÍCH GEN ftsZ - XÁC ĐỊNH VẬT CHỦ SẢN XUẤT HỢP CHẤT TỰ NHIÊN ONNAMIDE TỪ THEONELLA SWINHOEI Nguyễn Tú Anh* TÓM TẮT Mục tiêu: xác định v t chủ sản xuất hợp chất tự nhiên onnamide từ Theonella swinhoei căn cứ trên kết quả phân tích gen ftsZ. Phương pháp: khuếch đại gen ftsZ từ ADN toàn phần của T. swinhoei bằng cặp mồi đặc hiệu, giải trình tự và phân tích bằng chương trình BLAST và BioEdit - ClustalW. Kết quả: phân tích trình tự nucleotid các ftsZ từ ADN toàn phần của T. swinhoei cho thấy có độ tương đồng từ 56 - 58% với gen ftsZ của loài Dehalococcoides ethenogenes thuộc ngành Chloroflexi. Trình tự các gen ftsZ phân l p được có độ tương đồng cao với nhau ( 96%), nhưng không giống nhau hoàn toàn. Kết luận: kết quả này đã đặt ra giả thuyết có nhi u biến thể gen ftsZ từ những chủng vi khuẩn (VK) cộng sinh khác nhau để giải thích hiện tượng tìm thấy nhi u hợp chất thuộc họ onnamide từ T. swinhoei. * Từ khóa: Theonella swinhoei; Onnamide; Gen ftsZ, Chloroflexi; Vi sinh v t cộng sinh. Determination of the Producer of Onnamides from the Theonella Swinhoei Based on the ftsZ Gene Summary Objectives: To determine the producer of onnamides from the Theonella swinhoei based on the ftsZ gene. Methods: Amplify the ftsZ gene from the metagenomic DNA of T. swinhoei using the specific primers. These PCR products were sent for sequencing and analyzed applying BLAST and BioEdit - ClustalW. Results: Nucleotide sequence analysis showed that the amplicons from the metagenomic DNA of T. swinhoei had the identity ranging from 56 to 58% with the ftsZ of Dehalococcoides ethenogenes, a member of the phylum Chloroflexi. These cloned FtsZ amplicons shared high but not complete identities ( 96%). Conclusion: These results demonstrate the existence of multiple closely related ftsZ variants inside the metagenomic DNA of T. swinhoei. This might explain the presence of closely related onnamide variants, which could belong to distinct, diversified .
