Bài viết phân tích nguy cơ suy thái môi trường vịnh Hạ Long như ô nhiễm, đục nước, bùn khoáng và nông hóa đáy vịnh; tai biến môi trường như nước dâng cao, bão tố, giông lốc, mưa lớn, xói lỏ bờ bãi và sa bồi luồng bến tràn dầu . đánh bắt và nuôi trồng quá mức, khai thác bằng phương tiện hủy hoại nguồn lợi; mất nơi cư trú của sinh vật dẫn đến suy giảm nguồn lợi thủy sản và đa dạng sinh học. Các nguy cơ này đến từ nguồn gốc tự nhiên và nhân tác, xuất hiện dước các áp lực tại chỗ, trên đất liền, xuyên lưu vực và cả xuyên lãnh hải.
