Về phân tích dịch tễ học, các chủng phân lập 2008 và 2011 của chúng tôi, theo đúng các chu kì đỉnh điểm dịch bệnh ở các giai đoạn 2007-2008, 2010-2011và là các chủng có độc lực rất cao do có tính đồng nhất cao và cùng nhóm với các chủng cường độc cao của Trung Quốc tại thời điểm đó. Chúng tôi nhận định, các đợt dịch do PRRSV độc lực cao ở Việt Nam phụ thuộc vào các đợt dịch của Trung Quốc và PRRSV gây ra ở Việt Nam có nguồn gốc từ Trung Quốc. | Tạp chí Công nghệ Sinh học 15(1): 31-38, 2017 XÁC ĐỊNH GENOTYPE, PHẢ HỆ VÀ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC PHÂN TỬ CỦA MỘT SỐ CHỦNG VIRUS GÂY HỘI CHỨNG RỐI LOẠN SINH SẢN VÀ HÔ HẤP Ở LỢN (PRRSV) TẠI VIỆT NAM Lê Thanh Hòa*, Đỗ Thị Roan, Nguyễn Thị Khuê, Đoàn Thị Thanh Hương, Nguyễn Thị Bích Nga Viện Công nghệ sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam * Người chịu trách nhiệm liên lạc. E-mail: imibtvn@ Ngày nhận bài: Ngày nhận đăng: TÓM TẮT Chuỗi nucleotide ORF5 mã hóa protein kháng nguyên GP5 của 11 mẫu virus gây hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn (PRRSV) từ một số địa phương trong cả nước giai đoạn 2008-2011 được phân tích về đặc điểm phân tử (nucleotide và amino acid). Mười một chuỗi nucleotide của GP5 (ORF5) này được so sánh với một số chủng đại diện PRRSV lưu hành ở Việt Nam và thế giới nhằm xác định genotype, dịch tễ phân tử và phả hệ nguồn gốc. Phân tích nucleotide và amino acid suy diễn cho thấy mức độ tương đồng rất cao (98 – 100%) giữa các chủng PRRSV Việt Nam và Trung Quốc. Phân tích phả hệ dựa trên chuỗi nucleotide của ORF5 cho thấy hai phân nhóm lớn có nguồn gốc châu Mỹ (North American lineage) thuộc genotype 2, bao gồm 11 chủng PRRSV trong nghiên cứu này và châu Âu (European lineage) thuộc genotype 1. Trong genotype 2, có sự phân hóa sâu hơn do tập hợp các phân nhóm có các chủng phân lập ở châu Á (Việt Nam, Trung Quốc, Ấn Độ), các chủng châu Âu/Mỹ (Áo, Mỹ, Đan Mạch) và một chủng ở phân nhóm riêng có nguồn gốc Canada năm 2012. Về phân tích dịch tễ học, các chủng phân lập 2008 và 2011 của chúng tôi, theo đúng các chu kì đỉnh điểm dịch bệnh ở các giai đoạn 2007-2008, 2010-2011và là các chủng có độc lực rất cao do có tính đồng nhất cao và cùng nhóm với các chủng cường độc cao của Trung Quốc tại thời điểm đó. Chúng tôi nhận định, các đợt dịch do PRRSV độc lực cao ở Việt Nam phụ thuộc vào các đợt dịch của Trung Quốc và PRRSV gây ra ở Việt Nam có nguồn gốc từ Trung Quốc. Từ khóa: dịch tễ học, độc lực, nguồn gốc, phả hệ,
