Zika là virus nguy hiểm gây nên tật đầu nhỏ và hội chứng guillain barré làm tê liệt thần kinh ở người lớn hoặc thậm chí tử vong. Năm 2016, Zika làm hàng triệu người mắc bệnh và hàng chục người tử vong trên thế giới. Tuy nhiên, chưa có thuốc đặc trị nào được FDA chấp thuận trong điều trị bệnh o virus zika gây ra. Đề tài được thực hiện với định hướng tìm ra các chất có tiềm năng ức chế tốt virus. | Nghiên cứu Y học Y Học TP. Hồ Chí Minh * Phụ Bản Tập 22 * Số 1 * 2018 NGHIÊN CỨU IN SILICO KHẢ NĂNG GẮN KẾT CỦA CÁC CHẤT TR N C[C PROTEIN CỦ VIRUS ZI Huỳnh Thị Kim Chi*, Nguyễn Thụy Việt Phương* TÓM TẮT Mở đầu: Zika là virus nguy hiểm gây nên tật đầu nhỏ và hội chứng Guillain-Barré làm tê liệt thần kinh ở người lớn hoặc thậm chí tử vong. Năm 2016, Zika l|m h|ng triệu người mắc bệnh và hàng chục người tử vong trên thế giới. Tuy nhiên, chưa có thuốc đặc trị n|o được FDA chấp thuận trong điều trị bệnh o virus Zika g}y ra. L nh v c nghiên cứu thuốc mới với s trợ gi p m{y t nh đ gi p t m kiếm nhanh c{c chất có tiềm năng ức chế tốt virus v a giảm chi ph v| n}ng cao hiệu quả c a nghiên cứu. Do đó, đề tài được th c hiện với định hướng t m ra c{c chất có tiềm năng ức chế tốt virus. Mục tiêu: Chọn lọc c{c chất có khả năng gắn kết tốt trên protein c a virus Zika. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Đối tượng nghiên cứu l| c{c protein đ ch NS1, NS2B-NS3, NS3, NS5 và các ligand thuộc nhóm chất đang thử nghiệm kháng virus Zika và nhóm chất tiềm năng t thiên nhiên. Qu{ tr nh gắn kết phân tử molecular ocking cho ligan trên protein được th c hiện bằng phần mềm AutoDock Vina phiên bản . Vị trí gắn được x{c định t liệu th c nghiệm hoặc phư ng ph{p ocking m . Đ{nh gi{ kết quả a trên năng lượng gắn kết điểm số ocking v| ph}n t ch tư ng t{c gi a protein v| ligan . Kết quả: Cấu trúc c a c{c protein được chọn là NS1 (Pdb id: 5K6K), NS2B-NS3 (Pdb id: 5GJ4), NS3 (Pdb id: 5MFX, 5GJB), NS5 (Pdb id: 5KQR, 5WXB). Ở nhóm các chất đang thử nghiệm kháng virus Zika, kết quả tư ng đối phù hợp với th c nghiệm. Ở nhóm chất tiềm năng t thiên nhiên, các chất có năng lượng gắn kết tốt là Geraniin (-11,1 ) và Epigallocatechin gallat (-9,2 trên protein NS5 P i 5KQR . Protein NS5 được xem l| protein th ch hợp cho c{c chất gắn kết tốt. Sau khi lọc qua quy luật 5 Lipinski, Epigallocatechin gallat là chất thỏa mãn các tiêu chí c a quy luật trên. Kết luận: Kết quả thu được góp phần
