Enzym histon deacetylase (HDAC) được xem là một trong những mục tiêu nghiên cứu phát triển các thuốc kháng ung thư, khả năng gắn kết giữa nhóm dẫn chất hydroxamic và mercaptoacetamid với HDAC2 được tiến hành nghiên cứu bằng phương pháp mô hình mô tả phân tử docking. Đồng thời, mô hình docking cũng được so sánh để tìm ra vị trí gắn kết chọn lọc cho enzym HDAC2. | Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 18 * Phụ bản của Số 2 * 2014 Nghiên cứu Y học NGHIÊN CỨU KHẢ NĂNG GẮN KẾT GIỮA ENZYM HISTON DEACETYLASE 2 VÀ NHÓM DẪN CHẤT HYDROXAMIC VÀ MERCAPTOACETAMID Thái Khắc Minh*, Nguyễn Hữu Nhân Tâm*, Hứa Ngọc Minh Tuyền*, Đỗ Trọng Nhất*, Đoàn Cao Sơn** TÓM TẮT Mở đầu: Enzym histon deacetylase (HDAC) được xem là một trong những mục tiêu nghiên cứu phát triển các thuốc kháng ung thư. Khả năng gắn kết giữa nhóm dẫn chất hydroxamic và mercaptoacetamid với HDAC2 được tiến hành nghiên cứu bằng phương pháp mô hình mô tả phân tử docking. Đồng thời, mô hình docking cũng được so sánh để tìm ra vị trí gắn kết chọn lọc cho enzym HDAC2. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Các dẫn chất hydroxamic và mercaptoacetamid đã xác định IC50 trên hoạt tính ức chế HDAC2 được tiến hành nghiên cứu trên khả năng gắn kết với cấu trúc kết tinh tinh thể HDAC2 (pdb 3MAX) bằng phần mềm LeadIT. Kết quả và bàn luận: Phân tích kết quả cho thấy các acid amin quan trọng trong gắn kết của nhóm dẫn chất nghiên cứu trên HDAC2 là Phe210, Phe155, Gly154, His146, His183, Asp269, Asp181, His145, Arg39, Gly305, Trp140, Ala141. Các chất có khả năng gắn kết với HDAC2 tốt hơn HDAC8. Trên HDAC2, phần dị vòng là benzo(d)thiazol tỏ ra gắn kết hiệu quả với hệ thống liên kết π-π với các acid amin Phe155, Phe210. Kết luận: Trong nghiên cứu này mô hình mô tả phân tử docking được tiến hành trên cấu trúc tinh thể chụp bằng tia X của enzym HDAC2 (3MAX) và các dẫn chất hydroxamic và mercaptoacetamid. Mô hình mô tả phân tử docking này có thể ứng dụng nhằm thiết kế ra các chất có khả năng ức chế mạnh và chuyên biệt HDAC2 nhằm mục tiêu tìm ra các hoạt chất có khả năng ứng dụng trong điều trị ung thư. Từ khóa: HDAC, docking, hydroxamic, mercaptoacetamid, ung thư, thiết kế thuốc ABSTRACT MOLECULAR INTERACTION BETWEEN HISTONE DEACETYLASE AND HYDROXAMIC, MERCAPTOACETAMIDE DERIVATIVES , Khac Minh Thai Nhan Tam Nguyen Huu, Huu Ngoc Minh Tuyen, Trong Nhat Do, Cao Son Doan * Y Hoc TP. Ho Chi Minh * Vol. 18
