Bài viết trình bày việc so sánh tương đồng giữa các chủng HP-PRRSV thực địa với các chủng virus vacxin thương mại. Trong nghiên cứu này, ba đoạn gen NSP2, ORF5 và ORF7 của 36 chủng HP-PRRSV thu thập tại các ổ dịch thực địa trong giai đoạn 2009-2014 được giải trình tự và phân tích tương đồng gen so với các chủng vacxin thương mại có mặt trên thị trường. | KHOA HỌC KỸ THUẬT THÚ Y TẬP XXIII SỐ 3 - 2016 SO SAÙNH TÖÔNG ÑOÀNG GEN GIÖÕA CAÙC CHUÛNG PRRSV ÑOÄC LÖÏC CAO THU THAÄP THÖÏC ÑÒA VÔÙI CAÙC CHUÛNG VACXIN THÖÔNG MAÏI Đỗ Tiến Duy, Nguyễn Tất Toàn Khoa Chăn nuôi Thú y, Trường ĐHNL TP. HCM TÓM TẮT Ba đoạn gen NSP2, ORF5 và ORF7 của 36 chủng HP-PRRSV thu thập tại các ổ dịch thực địa trong các năm 2009 - 2014 từ nhiều tỉnh thành đã được giải trình tự và phân tích tương đồng gen so với các chủng vacxin thương mại có mặt trên thị trường. Ở gen ORF5, các chủng thực địa có mức tương đồng nucleotid/amino acid (%) lần lượt: 86,8-99,7/84,0-99,5; 89,0-93,8/83,2-96,9; 84,198,8/88,1-92,1; 83,7-98,8/83,8-97,4; 83,3-98,5/81,4-96,9; 42,6-46,2/46,8-51,1 và 42,3-45,5/42,347,7 tương ứng so với chủng vacxin JXA1-R, P129 Fostera, ATCC VR-2332 Ingelvac, Resp PRRS Ingelvac, BCL-PS 100, Amervac PRRS và Porcilis PRRS. Ở gen ORF7, các chủng thực địa có sự tương đồng nucleotid (%) lần lượt 91,1-99,7/94,7-99,1; 90,3-95,6/94,7-99,9; 90,6-99,7/94,7-99,9; 90,6-99,7/94,7-99,9; 41,9-46,0/52,8-55,8 và 42,3-46,1/52,8-56,9 so với chủng vacxin JXA1-R, P129 Fostera, ATCC VR-2332 Ingelvac, Resp PRRS Ingelvac, Amervac PRRS và Porcilis PRRS. Sự đa dạng cao của các chủng thực địa dựa trên phân tích ORF5 và ORF7 dẫn đến mức tương đồng biến động lớn so với các chủng vacxin, nên việc xác định chủng nhiễm trên đàn heo hay vùng chăn nuôi có giá trị cho việc chọn vacxin phù hợp và hiệu quả tốt hơn. Từ khóa: HP-PRRSV thực địa, NSP2, ORF5, ORF7, Tương đồng gen, Vacxin Comparison of genomic homology among the highly virulent field HP-PRRSV strains isolated from 2009 to 2014 and the PRRSV strains of commercial vaccines Do Tien Duy, Nguyen Tat Toan SUMMARY Three genetic fragments including NSP2, ORF5 and ORF7 of 36 field HP-PRRSV strains isolated during 2009-2014 from several provinces were sequenced and analyzed on genetic similarity in comparison with the commercial vaccine strains. At ORF5, field HPPRRSV strains having the nucleotide/amino acid similarity
