Trong báo cáo này tiến hành giải mã và phân tích trình tự gen MatK của loài Sao hòn gai nhằm bổ sung cơ sở dữ liệu di truyền và xác định mối quan hệ di truyền của loài Sao hòn gai với một số loài họ Dầu khác trên thế giới. | HỘI NGHỊ KHOA HỌC TOÀN QUỐC VỀ SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT LẦN THỨ 5 TRÌNH TỰ GEN MATK CỦA LOÀI SAO HÒN GAI (Hopea hongayensis) Ở VIỆT NAM i n NGUYỄN THỊ PHƯƠNG TRANG i n inh h i v T i ng yên inh vậ n Kh a h v C ng ngh i a TẠ THỊ NHUNG, HÀ MINH TÂM Trường i h ư h i2 NGUYỄN VĂN THÀNH ườn Q gia i Tử L ng Sao hòn gai (Hopea hongayensis Tardieu) thuộc chi Sao, họ Dầu, là loài đặc hữu nên có giá trị về mặt khoa học, chúng còn có giá trị kinh tế, y học do có gỗ tốt và dùng làm thuốc. Tuy nhiên, hiện nay loài này đang đứng trước nguy cơ tuyệt chủng do mức độ suy giảm nơi sống và việc khai thác quá mức, đã được xếp vào thứ hạng cực kỳ nguy cấp (IUCN, 2012). Mặc dù vậy, cho đến nay chưa có bất kỳ công trình nào nghiên cứu riêng về loài này ở Việt Nam. Trong báo cáo này chúng tôi tiến hành giải mã và phân tích trình tự gen MatK của loài Sao hòn gai nhằm bổ sung cơ sở dữ liệu di truyền và xác định mối quan hệ di truyền của loài Sao hòn gai với một số loài họ Dầu khác trên thế giới. I. PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU Mẫu nghiên cứu là lá và vỏ cây loài Sao hòn gai thu tại đảo Ba Mùn, Vườn Quốc gia Bái Tử Long, tỉnh Quảng Ninh. T h A ổng : Mẫu được nghiền trong nitơ lỏng (-196oC) thành dạng bột mịn, lấy 100mg bột mẫu để tách DNA tổng số bằng Dneasy plant mini kit (Qiagen, Đức). Một đoạn gen MatK có chiều dài khoảng 900bp được nhân bản bằng kỹ thuật PCR sử dụng cặp mồi đặc hiệu MatK-F: 5’-CGA TCT ATT CAT TCA ATA TTT C-3’ và MatK-R: 5’- TCT AGC ACA CGA AAG TCG AAG T-3’. Thành phần hỗn hợp PCR tiêu chuẩn, có bổ sung BSA. Chu trình nhiệt của PCR: 96oC 2 phút; 35 chu kì gồm: 96oC 30 giây, 56oC 25 giây, 72oC 40 giây; 72oC 5 phút. Sản phẩm PCR được điện di kiểm tra trên gel Agarose 1% và tinh sạch bằng Qiaquyck gel extraction kit (Qiagen, Đức). Giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR sử dụng mồi MatK-F và bộ hóa chất BigDye terminator cycler , đọc kết quả trên hệ thống ABI 3100 Avant Genetic Analyzer (Applied Biosystems, Mỹ). Sử dụng các phần mềm Clustal và Mega để phân tích .
