Luận văn tập trung vào việc tổng hợp lại các quy tắc thiết kế siRNA hiệu quả và phương pháp dự đoán khả năng ức chế của siRNA. Đồng thời cũng tiến hành áp dụng thực nghiệm bằng một số phương pháp học máy và so sánh kết quả đạt được với các phương pháp học máy đã được tổng hợp. Kết quả đạt được giúp chúng ta có cách nhìn tổng quan và áp dụng một cách phù hợp vào giải quyết bài toán nhằm xây dựng một số mô hình dự đoán khả thi để đoán nhận khả năng ức chế của siRNA hỗ trợ cho việc điều chế thuốc. | ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ NGUYỄN BÁ QUÂN CÁC PHƢƠNG PHÁP DỰ ĐOÁN VÀ ỨNG DỤNG VÀO BÀI TOÁN ĐOÁN NHẬN KHẢ NĂNG ỨC CHẾ GEN CỦA siRNA Ngành: Hệ thống thông tin Chuyên ngành: Hệ thống thông tin Mã số: 60 48 01 04 TÓM TẮT LUẬN VĂN THẠC SĨ HỆ THỐNG THÔNG TIN HÀ NỘI - 2016 1 MỞ ĐẦU Andrew Fire và Craig Mello đã tiến hành nghiên cứu về cơ chế điều khiển biểu hiện gen ở giun tròn (C. Elegans), hai ông đã thực hiện hàng loạt các thí nghiệm của việc tiêm RNA vào bộ phận sinh dục của giun tròn và phát hiện ra cơ chế gọi là can thiệp RNA. Năm 2006 Fire và Mello đã nhận được giải thưởng Nobel cho những đóng góp của mình trong nghiên cứu về sự can thiệp RNA (RNAi). Quá trình nghiên cứu của họ và của người khác về việc phát hiện RNAi đã có một tác động to lớn về nghiên cứu y sinh học. Rất có thể sẽ được áp dụng trong y tế để tạo ra các loại thuốc mới để điều trị nhiều loại bệnh như virus cúm A, HIV, virus viêm gan B, ung thư Trong RNAi, các siRNA có thể được tổng hợp và tiêm vào tế bào để ức chế các mRNA, nhằm mục đích kiểm soát bệnh. Do đó tổng hợp các siRNA có hiệu quả cao để thiết kế các loại thuốc mới là một trong những vấn đề quan trọng nhất về nghiên cứu can thiệp RNA. Nghiên cứu trên siRNA được liên tục thử nghiệm để tìm ra các phương pháp hiệu quả trong đó nghiên cứu đầu tiên tập trung vào các vấn đề của việc tìm kiếm quy tắc thiết kế siRNA. Mỗi quy tắc thiết kế siRNA được tìm ra bởi các đặc tính quan trọng của nó tác động đến hiệu quả ức chế. Nhiều quy tắc thiết kế để tìm các siRNA có khả năng ức chế cao đã được phát hiện ra bởi các quá trình thực nghiệm sinh học và sinh học tính toán. Hướng nghiên cứu tiếp theo đó là tập trung vào các vấn đề xây dựng mô hình dự báo để dự đoán hiệu quả ức chế của các siRNA, các kỹ thuật học máy chủ yếu được sử dụng để giải quyết theo hướng nghiên cứu này. Tuy nhiên vẫn còn một số các hạn chế đó là hầu hết các quy tắc thiết kế siRNA có hiệu suất thấp và nhiều siRNA tạo ra không hoạt động hoặc không khả năng