Gen CDKN2A có liên quan đến bệnh tiền đái tháo đường và đái tháo đường týp 2 thông qua giảm khối lượng tế bào β và suy giảm tiết insulin. Phương pháp AS-PCR và RFLPPCR được sử dụng để xác định kiểu gen của đa hình rs10811661 gen CDKN2A trên lượng mẫu lớn của quần thể người Việt Nam. | JOURNAL OF SCIENCE OF HNUE Natural Sci. 2017, Vol. 62, No. 3, pp. 114-120 This paper is available online at DOI: XÁC ĐỊNH ĐA HÌNH rs10811661 GEN CDKN2A TRÊN QUẦN THỂ NGƯỜI VIỆT NAM SỬ DỤNG PHƯƠNG PHÁP AS-PCR VÀ RFLP-PCR Nguyễn Thị Trung Thu1, Bùi Thị Nhung2 và Trần Quang Bình3 1 2 Khoa Sinh học, Trường Đại học Sư phạm Hà Nội Khoa Dinh dưỡng học đường và Ngành nghề, Viện Dinh dưỡng Quốc gia 3 Khoa Miễn Dịch và Sinh học phân tử, Viện sinh dịch tễ Trung ương Tóm tắt. Gen CDKN2A có liên quan đến bệnh tiền đái tháo đường và đái tháo đường týp 2 thông qua giảm khối lượng tế bào β và suy giảm tiết insulin. Phương pháp AS-PCR và RFLPPCR được sử dụng để xác định kiểu gen của đa hình rs10811661 gen CDKN2A trên lượng mẫu lớn của quần thể người Việt Nam. Phương pháp AS-PCR sử dụng mồi ngược phát hiện alen C (Rc): 5’-GGTAATAGACTTACTGTCATCG-3’ và alen T (Rt):5’-GGTAATAGAC TTACTGTCATCA-3’ và mồi xuôi (F): 5’- TCAGTTAAGCAGATGAAATTC-3’, nhiệt độ bắt mồi là 52 o C với sự có mặt của alen C hoặc T thì sản phẩm có kích thước 208 bp. Phương pháp RFLP-PCR sử dụng mồi xuôi (F): 5’-ACCTTCAGCCACCTCTCTGTCTTTC-3’ và mồi ngược (R): 5’-CCCATCCTGGGTAGGAGGAGCC- 3’, nhiệt độ bắt mồi là 62 o C, sản phẩm có kích thước 350 bp. Sau khi sử dụng enzyme cắt giới hạn PagI thì kiểu genCC có 1 sản phẩm (350 bp), kiểu gen TT có 2 sản phẩm (280 bp và 70 bp), kiểu gen CT 3 sản phẩm (350 bp, 280 bp và 70 bp). Từ khóa: AS-PCR, RFLP-PCR, rs10811661, gen CDKN2A, xác định kiểu gen. 1. Mở đầu Gen CDKN2A nằm trên cánh ngắn của NST số 9 tại vị trí 21 từ vị trí 21967751 bp đến vị trí 21994490 bp, với kích thước: 26739 kb [1]. Cấu trúc của CDKN2A gồm 3 exon (exon 1α, exon 1β, exon 2, exon 3) và 3 intron. Exon 2 và exon 3 được ghép vào với một trong 2 exon đầu tiên thay thế 1α, 1β tạo thành 2 khung đọc khác nhau. Điều này dẫn đến tạo ra 2 sản phẩm protein P16INK$ và P14ARF- chất ức chế khối u ảnh hưởng đến tuyến tụy tăng sinh tế bào β [2]. Gen CDKN2A tăng tính .
