Bài viết tiến hành sàng lọc biến đổi của một số gen mt-tRNA ở một nhóm bệnh nhân UTĐTT người Việt Nam và dự đoán ảnh hưởng của một số vị trí biến đổi tìm được đến cấu trúc bậc hai của tRNA. Sử dụng kỹ thuật PCR-RFLP, giải trình tự ADN để sàng lọc biến đổi và phương pháp mô hình hóa phân tử RNA để dự đoán sự thay đổi cấu trúc bậc hai của chúng. | Biến đổi mới của một số gen ty thể mã hóa cho tRNA ở người bệnh nhân ung thư đại trực tràng người Việt Nam VNU Journal of Science: Natural Sciences and Technology, Vol. 35, No. 2 (2019) 36-43 Original Article Novel Alterations of Some Mitochondrial tRNA Genes in Vietnamese Colorectal Cancer Patients Pham Thi Bich1, Nguyen Thi Van1, Ta Van To2, Trinh Hong Thai1, 1 Faculty of Biology, VNU University of Science, 334 Nguyen Trai, Thanh Xuan, Hanoi, Vietnam 2 Department of Anatomical Pathology - Cytopatology, Vietnam National Cancer Hospital, 30 Cau Buou, Tan Trieu, Thanh Tri, Hanoi, Vietnam Received 14 January 2019 Revised 13 March 2019; Accepted 15 March 2019 Abstract: Some mutations of mt-DNA which encode tRNA (mt-tRNA) were previously reported to be associated with clinical manifestations of neuromuscular disorders syndrome. In addition, alterations of the mitochondrial genome have been suggested to contribute to mitochondrial dysfunction and tumorigenesis. Alterations in some mt-tRNA genes have also been identified in breast cancer, lung cancer and colorectal cancer. However, so far, there has not been any report on mt-tRNA gene alteration in the Vietnamese colorectal cancer patients. This study analyzes the alterations of some mt-tRNA genes in a group of Vietnamese colorectal cancer patients and predicts the influence of the alterations on the secondary structure of tRNA based on bioinformatic tools. PCR-RFLP and DNA sequencing methods were used to screen alterations; the secondary structure of tRNA was predicted in silico by using a tool of the Vienna RNA Websuite. The study results show that both A12309G and A12310G of tRNA Leu were identified together in two out of 98 patients, and both T12150G and C12154G of tRNAHis were identified in one out of 19 patients. 1 All these alterations are heteroplasmic and have not been reported in cancer patients so far. In particular, the C12154G .
