Đánh giá hiệu quả tách chiết DNA tổng số từ một số quy trình phân tích khác nhau và bước đầu phân tích đa dạng di truyền nguồn gen Dây Thường Xuân (Hedera nepalensis K. Koch.) dựa vào chỉ thị GBSSI

Trong nghiên cứu này, bốn phương pháp tách chiết DNA khác nhau từ mẫu lá khô Dây thường xuân đã được sử dụng để tìm ra phương pháp hiệu quả nhất. Các phương pháp tách chiết khác nhau cho DNA tổng số có nồng độ dao động từ 10,5 đến 437,4 ng/μl, độ tinh sạch đánh giá thông qua chỉ số hấp thụ quang đo ở bước sóng 260 và 280 nm dao động từ 1,8 đến 2,2. | Đánh giá hiệu quả tách chiết DNA tổng số từ một số quy trình phân tích khác nhau và bước đầu phân tích đa dạng di truyền nguồn gen Dây Thường Xuân (Hedera nepalensis K. Koch.) dựa vào chỉ thị GBSSI VNU Journal of Science: Medical and Pharmaceutical Sciences, Vol. 35, No. 1 (2019) 88-95 Original Article Comparative Analysis of Different DNA Extraction Methods and Preliminary Analysis of Genetic Diversity of Hedera nepalensis K. Koch. in Vietnam Based on GBSSI Marker Dinh Doan Long1,*, Nguyen Xuan Bach1, Nguyen Thi Thu Thao1, Pham Thi Hong Nhung1, Do Thi Le Hang1, Vu Thi Thom1, Pham Thanh Huyen2 1 VNU School of Medicine and Pharmacy, 144 Xuan Thuy, Cau Giay, Hanoi, Vietnam 2 National Institute of Medicinal Materials, 3B Quang Trung, Hoan Kiem, Hanoi, Vietnam Received 03 May 2019 Revised 09 May 2019; Accepted 21 June 2019 Abstract: Though the ivy (Hedera nepalensis K. Koch.) has long been utilized in traditional medicine, its genome information is very limited. For plants, an effective method of DNA extraction is a very important step which greatly affects subsequent genetic analyses. In this study, four different methods of DNA extraction from dry leaves were used. A comparison of different protocols resulted in the yield of extracted DNA that ranged from to ng/μl and with a purity ranged from to . Based on the PCR results of GBSSI gene, Gene JET Plant Genomic DNA Purification Mini Kit is the most optimal extraction method for Vietnam ivy’s dry leaves. A preliminary analysis of the phylogenetic tree based on the GBSSI marker showed that ivy growing in a number of northern mountainous provinces of Vietnam belonged to the H. nepalensis K. Koch species. The high - quality total DNA will allow us to amplify different DNA markers, providing valuable genetic information to preserve and develop medicinal resources in Vietnam. Keywords: GBSSI, Hedera nepalensis K. Koch, DNA extraction.