Mục tiêu của nghiên cứu là bước đầu thu thập và đánh giá đa dạng di truyền vi khuẩn Xoc đang tồn tại ở miền Bắc Việt Nam. Mẫu lá bệnh được thu tại 5 tỉnh: Lào Cai, Thái Nguyên, Hà Nội, Thái Bình và Nam Định trong vụ mùa 2014 và được phân lập ra 23 chủng phân lập (isolate) bằng môi trường chọn lọc Wakimoto; kiểm tra bằng phương pháp multiplex PCR và lây nhiễm nhân tạo khẳng định 23 isolates đều là Xoc và thể hiện rõ độc tính gây bệnh đốm sọc. | Phân lập và khảo sát đa dạng di truyền của một số mẫu phân lập vi khuẩn Xanthomonas oryzae pv. oryzicola gây bệnh đốm sọc lúa ở một số tỉnh miền Bắc Việt Nam Vietnam J. Agri. Sci. 2019, Vol. 17, No. 3: 237-243 Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam 2019, 17(3): 237-243 PHÂN LẬP VÀ KHẢO SÁT ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA MỘT SỐ MẪU PHÂN LẬP VI KHUẨN Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GÂY BỆNH ĐỐM SỌC LÚA Ở MỘT SỐ TỈNH MIỀN BẮC VIỆT NAM Nguyễn Quốc Trung*, Nguyễn Thị Diên Khoa Công nghệ Sinh học, Học viện Nông nghiệp Việt Nam * Tác giả liên hệ: nqtrung@ Ngày nhận bài: Ngày chấp nhận đăng: TÓM TẮT Bệnh đốm sọc vi khuẩn ở lúa gây ra bởi vi khuẩn Xanthomonas oryzae pv. oryzicola (Xoc) là một trong những bệnh gây hại nguy hiểm ngày càng gây thiệt hại lớn đến năng xuất. Gần đây, tình trạng nhiễm bệnh xảy ra trên diện rộng ở Việt Nam, đặc biệt trong vụ mùa. Mục tiêu của nghiên cứu là bước đầu thu thập và đánh giá đa dạng di truyền vi khuẩn Xoc đang tồn tại ở miền Bắc Việt Nam. Mẫu lá bệnh được thu tại 5 tỉnh: Lào Cai, Thái Nguyên, Hà Nội, Thái Bình và Nam Định trong vụ mùa 2014 và được phân lập ra 23 chủng phân lập (isolate) bằng môi trường chọn lọc Wakimoto; kiểm tra bằng phương pháp multiplex PCR và lây nhiễm nhân tạo khẳng định 23 isolates đều là Xoc và thể hiện rõ độc tính gây bệnh đốm sọc. Kết quả phân tích đa dạng di truyền bằng phương pháp Repetive PCR và Inserted sequenced PCR sử dụng 3 chỉ thị ERIC2F, BOXA1RF và J3F đã xây dựng được sơ đồ hình cây về mức tương đồng di truyền. Ở mức tương đồng 0,72 các isolate được chia thành 4 nhóm phân bố đặc trưng theo địa điểm lấy mẫu. Kết quả bước đầu phân lập thành công vi khuẩn Xoc ở miền Bắc Việt Nam và việc phân tích đa dạng các nhóm Xoc cung cấp thông tin hữu ích về quần thể dịch hại định hướng cho công tác chọn tạo giống kháng bệnh và bảo vệ thực vật. Từ khóa: Bệnh đốm sọc, Xanthomonas oryzae pv. oryzicola, multiplex PCR, đa .
