Caspase-1 là một enzym có vai trò quan trọng trong việc chuyển hóa interleukin-1β, một cytokin tiền viêm tham gia vào nhiều phản ứng miễn dịch của cơ thể. Việc ức chế caspase-1 góp phần giảm sản xuất interleukin-1β và interleukin-18, từ đó hỗ trợ trong việc điều trị các bệnh như thoái hóa khớp và viêm khớp dạng thấp. Các mô hình sàng lọc ảo được xây dựng để tìm kiếm các có khả năng ức chế caspase-1 từ các cơ sở dữ liệu. | Sàng lọc ảo các chất có khả năng ức chế Caspase-1 Nghiên cứu Y học Y Học TP. Hồ Chí Minh * Phụ Bản Tập 23 * Số 2 * 2019 SÀNG LỌC ẢO CÁC CHẤT CÓ KHẢ NĂNG ỨC CHẾ CASPASE-1 Thái Khắc Minh*, Nguyễn Tuấn Huy*, Lê Minh Trí*,** TÓMTẮT Mở đầu: Caspase-1 là một enzym có vai trò quan trọng trong việc chuyển hóa interleukin-1β, một cytokin tiền viêm tham gia vào nhiều phản ứng miễn dịch của cơ thể. Việc ức chế caspase-1 góp phần giảm sản xuất interleukin-1β và interleukin-18, từ đó hỗ trợ trong việc điều trị các bệnh như thoái hóa khớp và viêm khớp dạng thấp. Các mô hình sàng lọc ảo được xây dựng để tìm kiếm các có khả năng ức chế caspase-1 từ các cơ sỡ dữ liệu. Đối tượng – Phương pháp nghiên cứu: Các mô hình in silico bao gồm 3D pharmacophore, 2D- QSAR, docking nghiên cứu trên cơ sở dữ liệu gồm 134 chất đã được thử nghiệm hoạt tính sinh học ức chế caspase-1, cấu trúc tinh thể caspase-1 mã pdb 2hbq. Kết quả: Mô hình 3D pharmacophore sáu điểm được xây dựng gồm một điểm tương tác kị nước, bốn điểm nhận liên kết hydro và một điểm cho liên kết hydro, được ứng dụng để sàng lọc các cấu trúc tương đồng với các chất có hoạt tính đã biết. Mô hình 2D-QSAR được xây dựng từ mối tương quan giữa giá trị hoạt tính sinh học thực nghiệm và ba thông số mô tả phân tử có kết quả R2 = 0,8 và RMSE = 0,72. Mô hình 2D-QSAR giúp dự đoán giá trị hoạt tính sinh học để lựa chọn các phối tử tiềm năng. Mô hình docking được tiến hành cấu trúc pdb 2hbq cho thấy các chất có sự tương tác tốt với các acid amin quan trọng như Arg179, Cys285. Tiến hành sàng lọc qua các mô hình in silico tìm ra được 26 chất có khả năng ức chế caspase-1. Kết luận: Với kết quả thu được, nghiên cứu đề nghị thử nghiệm hoạt tính sinh học in vitro và in vivo đối với 26 chất và tiến hành sàng lọc trên các enzym caspase để đánh giá mức độ chọn lọc của các chất thu được. Từ khóa: caspase-1, interleukin-1β, interleukin-18, thoái hóa khớp, viêm khớp dạng thấp. ABSTRACT VIRTUAL SCREENING ON .
