Tôm sú (Penaeus monodon) là loài thủy sản nuôi trồng đem lại nguồn lợi lớn cho quốc gia. Trong những năm gần đây, xuất khẩu tôm sú có thể đạt gần một tỷ USD/năm. Tuy nhiên, các dữ liệu về hệ gen và hệ phiên mã của tôm sú còn hạn chế khiến cho việc nghiên cứu phục vụ cho việc chọn tạo giống với những tính trạng quan trọng như tăng trưởng nhanh, kháng bệnh còn gặp nhiều khó khăn. | Phân tích hệ phiên mã và sàng lọc một số gen giả định liên quan tới tính trạng tăng trưởng ở tôm sú (Penaeus monodon) Tạp chí Công nghệ Sinh học 15(3): 471-480, 2017 PHÂN TÍCH HỆ PHIÊN MÃ VÀ SÀNG LỌC MỘT SỐ GEN GIẢ ĐỊNH LIÊN QUAN TỚI TÍNH TRẠNG TĂNG TRƯỞNG Ở TÔM SÚ (PENAEUS MONODON) Nguyễn Hải Bằng1, Phạm Quang Huy2, Trần Xuân Thạch2, Nguyễn Giang Thu3, Nguyễn Thị Minh Thanh2, Nguyễn Thị Hoa2, Hà Thị Thu2, Nguyễn Thị Tuyết Nhung2, Nguyễn Cường2, Nguyễn Hữu Ninh4, Đồng Văn Quyền2, Chu Hoàng Hà2, Đinh Duy Kháng2, * 1 Trường Đại học Y Dược Hải Phòng 2 Viện Công nghệ sinh học, Viện Hàn lâm khoa học và Công nghệ Việt Nam 3 Vụ Khoa học công nghệ và Môi trường, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn 4 Viện nghiên cứu nuôi trồng thủy sản III, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn * Người chịu trách nhiệm liên lạc. E-mail: khangvspt@ Ngày nhận bài: Ngày nhận đăng: TÓM TẮT Tôm sú (Penaeus monodon) là loài thủy sản nuôi trồng đem lại nguồn lợi lớn cho quốc gia. Trong những năm gần đây, xuất khẩu tôm sú có thể đạt gần một tỷ USD/năm. Tuy nhiên, các dữ liệu về hệ gen và hệ phiên mã của tôm sú còn hạn chế khiến cho việc nghiên cứu phục vụ cho việc chọn tạo giống với những tính trạng quan trọng như tăng trưởng nhanh, kháng bệnh còn gặp nhiều khó khăn. Giải trình tự và phân tích hệ phiên mã tôm sú sẽ cung cấp các dữ liệu quan trọng cho công tác chọn giống tôm sú. Trong nghiên cứu này, từ gói dữ liệu giải trình tự thế hệ mới mô cơ và mô gan tụy tôm sú thu nhận từ vùng biển Bắc Trung Bộ Việt Nam, chúng tôi đã đánh giá, tiền xử lý và lắp ráp de novo hệ phiên mã, tinh sạch và thu được unigene với kích thước trung bình là 403,06 bp, N50 là 402 bp. Toàn bộ các unigene trong hệ phiên mã tinh sạch được chú giải với 4 cơ sở dữ liệu khác nhau và đã sàng lọc được 51 unigene liên quan đến tính trạng tăng trưởng. Phân tích biểu hiện cho thấy unigene có sự biểu hiện khác biệt giữa mô cơ và
