Bài giảng Giới thiệu ngôn ngữ R Markdown và mục tiêu tái lập; một session với R Markdown; một document của R Markdown; phân tích mô hình hồi quy tuyến tính. | Bài giảng Giới thiệu ngôn ngữ R Markdown Tuan V. Nguyen Garvan Institute of Medical Research Professor, UNSW School of Public Health and Community Medicine Professor of Predictive Medicine, University of Technology Sydney Adj. Professor of Epidemiology and Biostatistics, School of Medicine Sydney, University of Notre Dame Australia Phân tích dữ liệu và ứng dụng | Đại học Dược Hà Nội | 12/6 to 17/6/2019 © Tuan V. Nguyen RMardown, RStudio, R • R là nền tảng • R Studio được xây dựng trên R – có 'menu' và giao diện biểu đồ • R Mardown là một phần của RStudio – giúp 'document' mã R – tái lập (reproducibility) R Studio • Download R Studio • R Markdown có trong R Studio R mardown Data objects Mã R Output Vận hành của R Studio Có thể lưu mã R và output bằng cách dùng File/Save R Markdown và mục tiêu tái lập Đảm bảo tính reproducibility: dữ liệu + mã R + văn bản R Markdown • R + Markdown = RMarkdown • Có thể xem là một "markup language" • Lưu trữ mã R • Export output sang Word, pdf, html Một session với R Markdown Một document của R Markdown • Header • R codes • Output Một document của R Markdown # Phân tích tương quan giữa BMI và pcfat ## Dữ liệu obesity data, Việt Nam • Header ### PI: Tuan Nguyen • R codes # Đọc dữ liệu vào R ``` {r} • Output ob = ("~/Dropbox/_Lectures and Talks/UTS Data Analytics 2019/obesity ;) head(ob) summary(lm(pcfat ~ bmi, data=ob)) Giữa ``` và ``` là R codes # Vẽ mối tương quan giữa BMI và pcfat library(ggplot2) p = ggplot(data=ob, aes(x=bmi, y=pcfat, ol=gender)) p + geom_point() + geom_smooth(method="lm") ``` Header Header R codes R codes in-line R codes Output R Markdown codes and output --- title: "Analysis of obesity" author: "Tuan Nguyen" date: "4/22/2019" output: html_document --- # Analysis of obesity .
