Nhân tố phiên mã TCP là nhóm protein điều hòa quan trọng, được chứng minh tham gia vào quá trình sinh trưởng và phát triển ở thực vật. Tuy nhiên, chưa có ghi nhận nào về nhóm TCP ở bưởi (Citrus grandis). Vì vậy, mục tiêu của nghiên cứu này nhằm xác định và làm rõ về các đặc tính cơ bản của nhóm TCP ở bưởi. | Phân tích cấu trúc và khai thác dữ liệu biểu hiện của họ gene mã hóa nhân tố phiên mã TCP ở cây bưởi Citrus grandis Vietnam J. Agri. Sci. 2020 Vol. 18 No. 4 289-296 Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam 2020 18 4 289-296 PHÂN TÍCH CẤU TRÚC VÀ KHAI THÁC DỮ LIỆU BIỂU HIỆN CỦA HỌ GENE MÃ HÓA NHÂN TỐ PHIÊN MÃ TCP Ở CÂY BƯỞI Citrus grandis Chu Đức Hà1 Nguyễn Thu Hường1 2 Bùi Thị Thu Hương2 La Việt Hồng3 Lê Thị Ngọc Quỳnh4 Phạm Phương Thu3 Nguyễn Văn Lộc5 1 Viện Di truyền Nông nghiệp Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam 2 Khoa Công nghệ sinh học Học viện Nông nghiệp Việt Nam 3 Khoa Sinh - Kỹ thuật Nông nghiệp Đại học Sư phạm Hà Nội 2 4 Khoa Hóa và Môi trường Đại học Thủy lợi 5 Khoa Nông học Học viện Nông nghiệp Việt Nam Tác giả liên hệ hachu_amser@ Ngày nhận bài Ngày chấp nhận đăng TÓM TẮT Nhân tố phiên mã TCP là nhóm protein điều hòa quan trọng được chứng minh tham gia vào quá trình sinh trưởng và phát triển ở thực vật. Tuy nhiên chưa có ghi nhận nào về nhóm TCP ở bưởi Citrus grandis . Vì vậy mục tiêu của nghiên cứu này nhằm xác định và làm rõ về các đặc tính cơ bản của nhóm TCP ở bưởi. Kết quả cho thấy tổng số 21 gene mã hóa TCP đã được xác định trên hệ gene của bưởi. Thông qua các công cụ tin sinh học các TCP ở bưởi có đặc tính lý hóa rất đa dạng có tính ưa nước tương tự như ở các loài thực vật khác. Hầu hết họ gene CgTCP chỉ chứa 1 exon. Nhóm TCP ở bưởi có thể được chia làm 3 nhóm đặc trưng cho thực vật bao gồm nhóm PCF1 CIN và CYC TB1. Khai thác dữ liệu phiên mã của cam ngọt C. sinensis cho thấy các gene tương đồng với CgTCP02 được tăng cường biểu hiện ở lá hoa và quả. Kết quả của nghiên cứu này đã cung cấp những thông tin cơ bản về nhóm TCP ở bưởi và bước đầu đánh giá mức độ biểu hiện của gene mã hóa TCP ở các cơ quan từ đó định hướng cho các phân tích chức năng gene sau này. Từ khóa Citrus grandis nhân tố phiên mã TCP cấu trúc biểu hiện gene. Structural Analysis and Data Mining of the Expression Profiles of Genes .
