Với mục đích kiểm định cá Tra (Pangasianodon hypophthalmus), việc xây dựng quy trình phân tích đoạn Cytochrome b là cần thiết. Cặp mồi universal cho Cytb được sử dụng để nhân gen thuộc vùng gen ty thể thông qua PCR các mẫu cá Tra và một số loài cá da trơn khác với kích thước 430 bp. Sản phẩm PCR sau đó được tinh sạch và giải trình tự. | VIỆN NGHIÊN CỨU NUÔI TRỒNG THỦY SẢN II QUY TRÌNH PHÂN TÍCH ĐOẠN CYTOCHROME B TRÊN CÁC MẪU CÁ TRA Pangasianodon hypophthalmus Trần Nguyễn Ái Hằng1 Trần Thị Thúy Hà2 TÓM TẮT Với mục đích kiểm định cá Tra Pangasianodon hypophthalmus việc xây dựng quy trình phân tích đoạn Cytochrome b là cần thiết. Cặp mồi universal cho Cytb được sử dụng để nhân gen thuộc vùng gen ty thể thông qua PCR các mẫu cá Tra và một số loài cá da trơn khác với kích thước 430 bp. Sản phẩm PCR sau đó được tinh sạch và giải trình tự. Các chuỗi trình tự nghiên cứu sau khi giải cần phải được xử lý sơ bộ trước khi được đưa vào chương trình phân tích chính. Đầu tiên các chuỗi trình tự cần được kiểm tra chất lượng giải trình tự và xử lý bằng kết hợp hai phần mềm FinchTV và Bioedit để đạt được trình tự chuẩn xác nhất cho các bước phân tích tiếp theo. Kế tiếp dùng phần mềm BLAST của NCBI để so sánh và xác định mức độ tương đồng của mẫu nghiên cứu với trình tự chuẩn đã được công bố trong dữ liệu của NCBI. Cuối cùng phần mềm Mega 6 sẽ là phần mềm thích hợp cho các phân tích về sự phát sinh loài và khoảng cách di truyền của cá Tra và những loài cá da trơn khác trong họ Pangasiidae muốn quan tâm. Từ khóa cá Tra Cytochrome b FinchTV và Bioedit Pangasianodon hypophthalmus quy trình phân tích đoạn I. ĐẶT VẤN ĐỀ đoạn trong vòng đời trứng và ấu trùng thậm Theo Ủy hội sông Mekong MRC Mekong chí còn phức tạp hơn việc nhận dạng khi trưởng River Commission thì Việt Nam có tổng số 13- thành. 14 loài trong họ Pangasiidae bao gồm 1 loài Ngày nay sự phát triển vượt bậc của ngành thuộc giống Helicophagus 11 loài thuộc giống gienome học gienomics và các thiết bị thế hệ Pangasius và 2 loài thuộc giống Pangasianodon mới đã mở đường cho việc nghiên cứu toàn bộ MRC 2008 . Tuy nhiên việc phân loại dựa vào gienome của các sinh vật thủy sản. Đặc biệt với hình thái học biến động lớn và còn nhiều tranh sự xuất hiện của kỹ thuật giải trình tự giene thế cãi. Hiện nay một số trang web cung cấp thông hệ mới đã giảm chi phí và nhân công
