Bài viết được tiến hành nhằm nghiên cứu chức năng của QTL9 liên quan đến cấu trúc bông [24], các quần thể lai tái tổ hợp đã được phát triển bằng cách lai 2 giống bố mẹ G6 và G189 thuộc 2 haplotype đối lập về cấu trúc bông (bông to và nhỏ). | Khoa học Nông nghiệp Chọn lọc các cá thể F2 đồng hợp tử mang QTL9 liên quan đến cấu trúc bông lúa bằng chỉ thị phân tử CAPS Phạm Thị Mai1 Lê Thị Như1 Stefan Jouannic2 Khổng Ngân Giang1 1 Phòng thí nghiệm trọng điểm công nghệ tế bào thực vật Viện Di truyền Nông nghiệp Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam 2 Viện Nghiên cứu phát triển Montpellier Đại học Montpellier Pháp Ngày nhận bài 28 9 2020 ngày chuyển phản biện 1 10 2020 ngày nhận phản biện 30 10 2020 ngày chấp nhận đăng 19 11 2020 Tóm tắt QTL9 là một tính trạng số lượng tiềm năng mới liên quan đến cấu trúc bông lúa được xác định thông qua phân tích liên kết trên toàn hệ gen GWAS quần thể lúa bản địa Việt Nam. Các quần thể lai tái tổ hợp đã được phát triển từ 2 giống lúa bố mẹ G6 và G189 thuộc 2 haplotype tương phản về số gié thứ cấp bông và số hạt bông nhằm nghiên cứu chức năng của QTL9. Bên cạnh đó sử dụng công nghệ gen capture kết hợp với giải trình tự thế hệ mới đã xác định được biến thể di truyền trong vùng QTL9 của 2 giống bố mẹ trong đó 12 điểm đột biến đa hình đơn nucleotide SNPs được tìm thấy nằm trong vùng cắt của 5 enzym giới hạn. Trong nghiên cứu này 12 cặp mồi đã được thử nghiệm để nhân chỉ thị CAPS Cleaved Amplified Polymorphic Sequences được phát triển dựa vào 12 SNPs trên nhằm ứng dụng để chọn lọc các dòng F2 đồng hợp tử mang kiểu gen QTL9 của bố và của mẹ. Phân tích sản phẩm PCR và cắt enzym giới hạn chọn lọc được 4 chỉ thị CAPS cho sự đa hình giữa 2 giống bố mẹ và phân bố bao phủ vùng QTL9. Kết quả đánh giá quần thể F2 gồm 275 cá thể bằng 3 chỉ thị CAPS thu được 74 dòng đồng hợp tử mang kiểu gen QTL9 của mẹ 66 dòng đồng hợp tử mang kiểu gen QTL9 của bố và 135 dòng dị hợp tử. Các dòng đồng hợp tử sẽ được sử dụng để phát triển quần thể F3 đánh giá kiểu hình cấu trúc bông của quần thể F3 để làm sáng tỏ vai trò của QTL9 liên quan đến cấu trúc bông lúa. Từ khóa cấu trúc bông lúa chỉ thị phân tử CAPS đồng hợp tử năng suất QTL quần thể F2. Chỉ số phân loại Đặt vấn đề đã được công bố trong vài
