Trong luận văn này, chúng tôi sẽ sử dụng các mô phỏng Monte – Carlotrên máy tính để xem xét sự phụ thuộc của độ dài tĩnh điện le và khoảng cách đầu – cuối Ree dây polymer vào bán kính chắn rs. Để thực hiện mô phỏng, chúng tôi sử dụng thư viện SimEngine được viết bởi TS. Nguyễn Thế Toàn. Đây là một thư viện mô phỏng vật lý modular dùng ngôn ngữ C++ và các mở rộng OpenMP, OpenCL để song song hóa các tính toán trên CPU nhiều lõi và trên GPGPU (card đồ họa tính toán). | ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN - Nguyễn Thị Trang NGHIÊN CỨU MÔ PHỎNG CỦA 1 SỐ BÀI TOÁN VỀ TĨNH ĐIỆN TRONG SINH HỌC LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC Hà Nội 2015 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN - Nguyễn Thị Trang NGHIÊN CỨU MÔ PHỎNG CỦA 1 SỐ BÀI TOÁN VỀ TĨNH ĐIỆN TRONG SINH HỌC Chuyên ngành Vật lí lí thuyết và vật lí toán Mã số 60 44 01 03 LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC TS NGUYỄN THẾ TOÀN Hà Nội 2015 LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành luận văn Nghiên cứu mô phỏng của 1 số bài toán tĩnh điện trong sinh học tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới TS. Nguyễn Thế Toàn Giảng viên Trường Đại học Khoa học Tự nhiên Đại học Quốc gia Hà Nội người đã tận tình hướng dẫn trang bị những kiến thức cơ bản và động viên trong suốt quá trình tôi thực hiện luận văn. Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới các thày cô giáo trong bộ môn Vật lý lý thuyết Khoa Vật lý Trường Đại học Khoa học Tự nhiên đã trang bị những kiến thức chuyên môn cần thiết và tạo mọi điều kiện thuận lợi để tôi hoàn thành luận văn này. Xin chân thành cảm ơn sự quan tâm giúp đỡ tạo điều kiện của Ban chủ nhiệm khoa Vật Lý phòng Sau Đại học trường Đại Học Khoa Học Tự Nhiên Đại Học Quốc Gia Hà Nội. Tôi xin gửi những lời cảm ơn tới gia đình cơ quan và các bạn bè đồng nghiệp đã luôn sát cánh giúp đỡ và động viên trong suốt quá trình tôi học tập và hoàn thành luận văn. Cuối cùng xin gửi lời cảm ơn quỹ NAFOSTED đề tài số đã hỗ trợ chúng tôi trong quá trình thực hiện đề tài nghiên cứu. Tôi xin chân thành cảm ơn Hà Nội tháng 6 năm 2015 Học viên thực hiện Nguyễn Thị Trang MỤC LỤC MỞ ĐẦU .1 1. Lý do chọn đề tài . 1 2. Phương pháp nghiên cứu . 3 3. Bố cục luận văn . 3 CHƯƠNG 1. TỔNG QUAN VỀ CẤU TRÚC VÀ MỘT SỐ TÍNH CHẤT VẬT LÝ CỦA PHÂN TỬ ADN .5 Cấu trúc hóa học của phân tử ADN . 5 Cấu trúc không gian của phân tử ADN . 8 Cấu trúc sơ cấp .8 Hiện tượng cuộn xoắn và các cấu trúc bậc cao của ADN. .9 ADN được xem như một polymer tích điện tính