Đồ án tốt nghiệp này được thực hiện với mục tiêu nhằm ly trích và thu nhận DNA vi khuẩn trực tiếp từ rơm trước và sau khi xử lý trong trồng nấm; xác định nhóm vi khuẩn trong rơm trước và sau khi xử lý trong trồng nấm bằng phương pháp PCR và DGGE, giải mã trình tự đoạn gene vùng V3 của đoạn 16S rDNA; thành lập cây phân loài của nhóm vi khuẩn có trong rơm trước và sau xử lý. Mời các bạn cùng tham khảo. | BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC KỸ THUẬT CÔNG NGHỆ TP. HCM ĐỒ ÁN TỐT NGHIỆP XÁC ĐỊNH CỘNG ĐỒNG VI SINH BẰNG PHƯƠNG PHÁP PCR VÀ DGGE TỪ RƠM TRƯỚC VÀ SAU KHI XỬ LÝ TRỒNG NẤM RƠM Ngành CÔNG NGHỆ SINH HỌC Chuyên ngành CÔNG NGHỆ SINH HỌC Giảng viên hướng dẫn TS. HOÀNG QUỐC KHÁNH CN. NGÔ ĐỨC DUY Sinh viên thực hiện HOÀNG NGỌC PHƯƠNG THẢO MSSV 0851110222 Lớp 08DSH4 TP. Hồ Chí Minh 2012 Đồ án tốt nghiệp LỜI MỞ ĐẦU 1. Tính cấp thiết của đề tài Nghiên cứu về cộng đồng vi sinh vật trong các môi trường sống nhằm tìm hiểu thêm đa dạng sinh học là một trong những mong muốn của các nhà khoa học trên thế giới. Trước đây để phân tích cộng đồng vi sinh vật trong các môi trường tự nhiên các nhà khoa học phải nuôi cấy và phân lập qua nhiều công đoạn khác nhau tốn thời gian và công sức nhưng lại không đem đến kết quả mong muốn. Trong số tất cả các vi sinh vật trong tự nhiên khoảng 99 không được phát hiện bằng kỹ thuật nuôi cấy. Vì vậy sinh học phân tử phương pháp nhận biết độc lập khuếch đại và giải trình tự gen 16S rDNA thường được sử dụng để có một dữ liệu đầy đủ hơn về một cộng đồng sống trong một môi trường cụ thể sinh học phân tử ra đời đã khắc phục những khó khăn vẫn còn hạn chế của công nghệ sinh học nhằm góp phần xác định cộng đồng của vi sinh vật trong môi trường nhanh chóng mà không phải qua nhiều giai đoạn nuôi cấy và phân lập qua đó giúp các nhà khoa học hiểu biết nhiều hơn về đa dạng sinh học từ đó đưa vào các ứng dụng nhằm phục vụ cho thực tiễn. Áp dụng sinh học phân tử để nghiên cứu cộng đồng vi sinh có trong rơm rạ ở giai đoạn trước và sau khi xử lý trong trồng nấm là rất cần thiết. Định danh hệ vi sinh vật có trong mẫu rơm bằng việc ly trích và thu nhận DNA trực tiếp so sánh sự thay đổi hệ vi sinh trong mẫu rơm ở các giai đoạn tiền xử lý trước khi đưa vào trồng nấm từ đó có thể bổ sung hệ vi sinh phù hợp vào giai đoạn rơm tiền xử lý nhằm rút ngắn thời gian ủ rơm trước khi đưa vào trồng nấm đem lại hiệu quả kinh tế cao hơn cho người dân. Đây cũng là bước khởi đầu
