Đồ án tốt nghiệp này được thực hiện với mục tiêu nhằm ly trích và thu nhận DNA genomic từ mẫu vi khuẩn đã phân lập trong quá trình trồng ủ rơm; xác định nhóm vi khuẩn bằng phương pháp PCR của đoạn gene 16S rNDA dựa trên cặp mồi 27F và 1492R. Trình tự cặp mồi 27F 5‘-GA GTT TGA TCM TGG CTC AG-3‘, 1492R 5'-GG CTA CCT TGT TAC GAC TT-3' . Mời các bạn cùng tham khảo. | BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC KỸ THUẬT CÔNG NGHỆ TP. HCM ĐỒ ÁN TỐT NGHIỆP KIỂM TRA ĐỘ TINH SẠCH ĐOẠN GENE 16S rDNA TRONG XÁC ĐỊNH LOÀI BẰNG PHƯƠNG PHÁP DGGE Ngành CÔNG NGHỆ SINH HỌC Chuyên ngành CÔNG NGHỆ SINH HỌC Giảng viên hướng dẫn TS. Hoàng Quốc Khánh CN Ngô Đức Duy Sinh viên thực hiện Hà Trầm Xuân MSSV 0851110305 Lớp 08DSH6 TP. Hồ Chí Minh 2012 ĐỒ ÁN TỐT NGHIỆP MỤC LỤC DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT . iv DANH MỤC CÁC BẢNG .v DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ ĐỒ THỊ SƠ ĐỒ . vi DANH MỤC CÁC HÌNH . vii LỜI MỞ ĐẦU .1 CHƯƠNG 1 TỔNG QUAN TÀI . Tổng quan về nhóm vi sinh vật . 5 . Các phương pháp ly trích và thu nhận DNA genomic . 5 . Phương pháp ly trích và thu nhận DNA tổng số vi sinh vật trong môi trường tự nhiên . 5 . Phương pháp ly trích và thu nhận DNA tổng số vi sinh vật từ dịch nuôi cấy. . 7 . Các ứng dụng của phương pháp PCR. 7 . Ứng dụng phương pháp PCR trong xác định trình tự nucleic acid. . 7 . Ứng dụng phương pháp PCR trong quá trình xác định loài vi sinh vật. . 7 . Ứng dụng phương pháp PCR trong phát hiện các tác nhân vi sinh vật gây bệnh nhiễm trùng. . 9 . Ứng dụng phương pháp PCR trong quá trình thúc đẩy nhanh công nghệ giải trình tự. . 9 . Ứng dụng phương pháp PCR trong chẩn đoán và sàng lọc bệnh di truyền. . 10 . Phương pháp DGGE và ứng dụng . 10 . Định danh nhóm vi khuẩn . 12 i ĐỒ ÁN TỐT NGHIỆP . Định danh bằng phương pháp truyền thống. 12 . Định danh nhóm vi khuẩn bằng sinh học phân tử. . 14 . Xây dựng cây phát sinh loài chủng loài. 19 CHƯƠNG 2 VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP .20 . Địa điểm nghiên cứu. 20 . Vật liệu thí nghiệm . 20 . Thiết bị và dụng cụ . 22 . Quy trình kiểm tra độ tinh sạch của đoạn gene 16S rDNA của từng chủng vi khuẩn. . 23 . Quy trình ly trích và thu nhận DNA genomic bằng nhiệt. . 24 . Quy trình kiểm tra sự xuất hiện DNA genomic trong mẫu sau khi ly trích. . 26 . Khuếch đại đoạn gene 16S rDNA của nhóm vi khuẩn bằng phương pháp PCR. . 27 . Tinh .
