Nghiên cứu này hướng tới mục tiêu xác định và phân tích đặc điểm của các gene SAP ở cây đu đủ, loại cây ăn quả nhiệt đới quan trọng, bằng các phương pháp tin sinh học, phương pháp nghiên cứu hiện đại, phổ biến trong công nghệ sinh học hiện đại. Mời các bạn cùng tham khảo! | HNUE JOURNAL OF SCIENCE DOI Natural Sciences 2021 Volume 66 Issue 1 pp. 111-118 This paper is available online at http XÁC ĐỊNH VÀ PHÂN TÍCH CÁC GENE MÃ HÓA PROTEIN LIÊN KẾT STRESS SAP Ở CÂY ĐU ĐỦ Carica papaya L. BẰNG PHƯƠNG PHÁP IN SILICO Lê Thị Mận1 Trần Thị Thanh Huyền2 Lê Chí Toàn3 Trần Thị Thanh Loan1 4 và Cao Phi Bằng1 1 Khoa Khoa học Tự nhiên Trường Đại học Hùng Vương 2 Khoa Sinh học Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 3 Khoa Sinh - Kĩ thuật Nông nghiệp Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2 4 Trường Trung học cơ sở Tiên Kiên Lâm Thao Phú Thọ Tóm tắt. Nhờ sử dụng các phương pháp nghiên cứu in silico chúng tôi đã xác định được 7 gene mã hóa các protein liên quan stress SAP ở trong hệ gene của cây Đu đủ Carica papaya L. . Các gene SAP của cây Đu đủ có kích thước từ 416 tới 813 nucleotide không có hoặc chỉ có một intron. Các protein suy diễn có kích thước từ 114 tới 270 amino acid khối lượng phân tử nằm trong khoảng 13 10 kDa tới 29 63 kDa. Các protein suy diễn có tính kiềm với pI dao động từ 8 82 đến 9 95. Căn cứ vào kết quả phân tích cấu trúc và cây phả hệ các SAP của cây Đu đủ được phân chia thành hai nhóm nhóm I năm gene và phân nhóm II hai gene . Các SAP này của cây Đu đủ có mức độ bảo tồn cao về cấu trúc với hai vùng bảo tồn A20-AN1 nhóm I hoặc vùng AN1 nhóm II . Phân tích dữ liệu RNA-seq được xây dựng từ lá đu đủ trong điều kiện thường và điều kiện đông lạnh cho thấy tất cả 7 gene SAP của cây Đu đủ đều biểu hiện và đều được cảm ứng biểu hiện mạnh hơn trong điều kiện đông lạnh so với điều kiện thường. Gene CpSAP2 có mức độ biểu hiện tương đối mạnh nhất trong các gene SAP của cây Đu đủ. Kết quả nghiên cứu này là cơ sở cho các nghiên cứu về tách dòng gene phân tích chức năng của các gene trong họ SAP và chọn giống ở cây Đu đủ trong đáp ứng với các điều kiện stress vô sinh của môi trường. Từ khóa biểu hiện gene cây Đu đủ Carica papaya L. cây phả hệ in silico protein liên kết stress SAP . 1. Mở đầu Các protein liên kết .
