Mục tiêu của đề tài nghiên cứu nhằm mở rộng độ đo Thông tin tương hỗ để tái tạo mạng trao đổi chất; tái tạo mạng trao đổi chất từ dữ liệu sinh học. Để hiểu rõ hơn về đề tài, mời các bạn cùng tham khảo nội dung chi tiết luận án! | Chương 1 MỞ ĐẦU Giới thiệu Trong khoảng một thập kỷ gần đây với sự phát triển nhanh chóng của ngành Công nghệ sinh học dữ liệu sinh học được sinh ra ngày một nhiều. Chẳng hạn dữ liệu biểu hiện gien gene expression data dữ liệu biểu sinh gien epigenetic data dữ liệu tương tác protein protein interaction data dữ liệu phổ khối lượng của mẫu sinh học metabolomic data . Các loại dữ liệu này gọi chung là dữ liệu sinh học hệ thống high-throughput data và thường được coi là quot ảnh chụp quot của các tổ chức sinh học. Việc phân tích các dữ liệu sinh học hệ thống để từ đó có thể xây dựng lại các mạng sinh học gọi là tái tạo mạng network reconstruction . Bài toán tái tạo mạng sinh học là một loại bài toán ngược. Đây là một bài toán quan trọng và đang là thách thức của ngành sinh học hệ thống. Việc tái tạo mạng sinh học giúp chúng ta làm sáng tỏ bản chất của các quá trình sinh học phức tạp và các cơ chế gây bệnh xảy ra bên trong tổ chức sinh học. Đặc biệt giúp chúng ta có thể tiên lượng chẩn đoán các tác nhân chỉ dấu sinh học gây bệnh. Từ đó giúp con người có thể can thiệp kịp thời và chính xác vào các quá trình đó như lựa chọn chế độ dinh dưỡng đưa ra phác đồ điều trị bệnh điều chế thuốc . . . . Trong một tổ chức sinh học mọi tiến trình sinh học đều được điều khiển bởi các phần tử cơ bản như gen protein metabolite. Quan hệ giữa các phần tử cơ bản trong tế bào sẽ quyết định đến chức năng của tế bào. Do đó từ dữ liệu sinh học quá trình tái tạo mạng sinh học thông qua các mối quan hệ giữa các phần tử sẽ cho chúng ta bức tranh tổng thể của sự sống. Cho đến nay có hai cách tiếp cận tái tạo mạng sinh học cách tiếp cận thực nghiệm trong lĩnh vực Sinh học và cách tiếp cận tính toán trong lĩnh vực Tin-Sinh. Với cách tiếp cận thực nghiệm các nhà thực nghiệm Sinh học sử dụng các phương tiện của công nghệ sinh học để đo đạc sự liên kết giữa các phần tử sau đó kết hợp với tri thức chuyên gia để tái tạo lại mô hình mạng sinh học. Cách tiếp cận này thường cho kết quả chính xác nhưng .
