Sierra: Discovery of differential transcript usage from polyA-captured single-cell RNA-seq data

High-throughput single-cell RNA-seq (scRNA-seq) is a powerful tool for studying gene expression in single cells. Most current scRNA-seq bioinformatics tools focus on analysing overall expression levels, largely ignoring alternative mRNA isoform expression. We present a computational pipeline, Sierra, that readily detects differential transcript usage from data generated by commonly used polyA-captured scRNA-seq technology. |

Trọng Kim 58 27 pdf

Upload

Không thể tạo bản xem trước, hãy bấm tải xuống

Tải xuống

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

Rapid scoring of genes in microbial pan-genome-wide association studies with Scoary

9 82 2

Summary of Doctoral Thesis in Biology: Sequencing and analysis of mitochondrial genome of 6 indigenous pig breeds in some Northern provinces of Vietnam

27 120 1

Millstone: Software for multiplex microbial genome analysis and engineering

7 208 2

The genome evolution and domestication of tropical fruit mango

17 248 1

EAGER: Efficient ancient genome reconstruction

14 195 1

Quantifying the mapping precision of genome-wide association studies using whole-genome sequencing data

10 53 2

HUPAN: A pan-genome analysis pipeline for human genomes

11 268 2

Genome-wide nucleotide patterns and potential mechanisms of genome divergence following domestication in maize and soybean

16 20 1

The whole genome sequence of the Mediterranean fruit fly, Ceratitis capitata (Wiedemann), reveals insights into the biology and adaptive evolution of a highly invasive pest species

31 89 1

AlleleAnalyzer: A tool for personalized and allele-specific sgRNA design

9 132 2

TÀI LIỆU XEM NHIỀU

Thiết kế kế hoạch bài học môn Toán theo định hướng phát triển năng lực học sinh

13 41409 2437

Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”

3 25309 252

31 Câu hỏi ôn tập môn Chủ nghĩa xã hội khoa học

25 25062 4310

Tiểu luận: Vai trò của Nguyễn Ái Quốc đối với việc thành lập Đảng Cộng sản Việt Nam

16 20484 2850

Tiểu luận Tình huống xử lý sai phạm trong thanh toán công tác phí lưu động

20 19868 1551

100 câu hỏi trắc nghiệm Triết học Mác-Lênin kèm đáp án

14 19791 2980

Bảng biến đổi Laplace và biến đổi Z

1 19686 625

Đề thi và Đáp án môn Tiếng Việt thực hành - ĐH SPKT TP.HCM

3 16613 332

Ebook Ôn luyện tiếng Anh 9 có đáp án: Phần 2 - Mai Lan Hương, Hà Thanh Uyên

37 16541 2961

Sự so sánh văn bản văn học và tác phẩm văn học

1 15196 139

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG

Bảo vệ tổ quốc xã hội chủ nghĩa trong quá trình xây dựng chủ nghĩa xã hội ở Việt Nam

11 15 1 23-11-2024

Đề thi giữa học kì 1 môn Địa lí lớp 12 năm 2023-2024 - Trường THPT Ngô Sĩ Liên, Bắc Giang

3 30 1 23-11-2024

Nghiên cứu các yếu tố tiên lượng tử vong ở bệnh nhi dưới 6 tuổi bỏng rất nặng

5 13 1 23-11-2024

Đề cương chi tiết học phần Lý luận về nhà nước và pháp luật (phần cụ thể)

22 161 3 23-11-2024

Khơi dậy khát vọng xây dựng chủ nghĩa xã hội cho thanh niên Việt Nam hiện nay

11 24 1 23-11-2024

‘Beyond places of safety’ – a qualitative study exploring the implementation of mental health crisis care innovations across England

14 15 1 23-11-2024

Đặc trưng cơ bản của chủ nghĩa xã hội - Từ quan điểm của chủ nghĩa Mác - Lênin đến thực tiễn Việt Nam

17 16 1 23-11-2024

Cost of digital technologies and family-observed DOT for a shorter MDR-TB regimen: A modelling study in Ethiopia, India and Uganda

9 19 1 23-11-2024

Standardizing post-cardiac arrest care across rural–urban settings – qualitative findings on proposed post-cardiac arrest learning community intervention

10 13 1 23-11-2024

How to adopt technologies in home care: A mixed methods study on user experiences and change of home care in Finland

15 17 1 23-11-2024

Screening for the high-need population using single institution versus state-wide admissions discharge transfer feed

6 15 1 23-11-2024

Effects of life-sustaining treatment plans on healthcare expenditure and healthcare utilization

8 15 1 23-11-2024

Nhu cầu chăm sóc giảm nhẹ của người bệnh ung thư tại Bệnh viện Việt Tiệp năm 2023

8 18 1 23-11-2024

Rituximab for the treatment of relapsing-remitting multiple sclerosis in Thailand: An economic evaluation and budget impact analysis

11 15 1 23-11-2024

Designing an optimal model of blood logistics management with the possibility of return in the three-level blood transfusion network

23 13 1 23-11-2024

Health care system costs related to potentially inappropriate medication use involving opioids in older adults in Canada

11 20 1 23-11-2024

What are the experiences of team members involved in root cause analysis? A qualitative study

8 16 1 23-11-2024

Ebook High voltage engineering - Theory and practice: Part 2

336 15 1 23-11-2024

Essential health services delivery and quality improvement actions under drought and food insecurity emergency in north-east Uganda

12 17 1 23-11-2024

Kết quả phẫu thuật nội soi cắt thực quản, tạo hình thực quản bằng dạ dày tại Trung tâm Ung Bướu Bệnh viện Hữu nghị Việt Tiệp

9 19 1 23-11-2024

TÀI LIỆU HOT

Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”

3 25309 252

Thiết kế kế hoạch bài học môn Toán theo định hướng phát triển năng lực học sinh

13 41409 2437

CẬP NHẬT KINH TẾ VĨ MÔ VIỆT NAM 6 tháng đầu năm 2020

3 3094 81

Sách trắng Doanh nghiệp Việt Nam năm 2020

580 5439 365

Việt Nam 2035 hướng tới thịnh vượng, sáng tạo, công bằng và dân chủ

584 3648 101

BÀI GIẢNG DỰNG HÌNH SKETCHUP 2020 BIÊN SOẠN : GV.KTS PHAN THỨC

62 7038 1

GIÁO TRÌNH TIẾNG ANH ENG BREAKING

171 6017 724

Quản trị khủng hoảng trong quan hệ công chúng

2 3492 78

Báo cáo thực tập chuyên ngành: Nghiên cứu, thiết kế, mô phỏng robot công nghiệp

51 4779 200

Đề tài “ Cân đối ngân sách nhà nước- thực trạng và hướng hoàn thiện”

53 5090 189