Choosing panels of genomics assays using submodular optimization

Due to the high cost of sequencing-based genomics assays such as ChIP-seq and DNase-seq, the epigenomic characterization of a cell type is typically carried out using a small panel of assay types. Deciding a priori which assays to perform is, thus, a critical step in many studies. We present the submodular selection of assays (SSA), a method for choosing a diverse panel of genomic assays that leverages methods from submodular optimization. |

Gia Cảnh 281 15 pdf

Upload

Không thể tạo bản xem trước, hãy bấm tải xuống

Tải xuống

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

Rapid scoring of genes in microbial pan-genome-wide association studies with Scoary

9 82 2

Summary of Doctoral Thesis in Biology: Sequencing and analysis of mitochondrial genome of 6 indigenous pig breeds in some Northern provinces of Vietnam

27 120 1

Millstone: Software for multiplex microbial genome analysis and engineering

7 208 2

The genome evolution and domestication of tropical fruit mango

17 248 1

EAGER: Efficient ancient genome reconstruction

14 195 1

Quantifying the mapping precision of genome-wide association studies using whole-genome sequencing data

10 53 2

HUPAN: A pan-genome analysis pipeline for human genomes

11 268 2

Genome-wide nucleotide patterns and potential mechanisms of genome divergence following domestication in maize and soybean

16 20 1

The whole genome sequence of the Mediterranean fruit fly, Ceratitis capitata (Wiedemann), reveals insights into the biology and adaptive evolution of a highly invasive pest species

31 89 1

AlleleAnalyzer: A tool for personalized and allele-specific sgRNA design

9 132 2

TÀI LIỆU XEM NHIỀU

Thiết kế kế hoạch bài học môn Toán theo định hướng phát triển năng lực học sinh

13 41410 2437

Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”

3 25311 252

31 Câu hỏi ôn tập môn Chủ nghĩa xã hội khoa học

25 25062 4310

Tiểu luận: Vai trò của Nguyễn Ái Quốc đối với việc thành lập Đảng Cộng sản Việt Nam

16 20484 2850

Tiểu luận Tình huống xử lý sai phạm trong thanh toán công tác phí lưu động

20 19868 1551

100 câu hỏi trắc nghiệm Triết học Mác-Lênin kèm đáp án

14 19791 2980

Bảng biến đổi Laplace và biến đổi Z

1 19686 625

Đề thi và Đáp án môn Tiếng Việt thực hành - ĐH SPKT TP.HCM

3 16613 332

Ebook Ôn luyện tiếng Anh 9 có đáp án: Phần 2 - Mai Lan Hương, Hà Thanh Uyên

37 16541 2961

Sự so sánh văn bản văn học và tác phẩm văn học

1 15196 139

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG

Critical care capacity and care bundles on medical wards in Malawi: A cross-sectional study

13 15 1 24-11-2024

Sexual workplace violence in the health sector in Saudi Arabia: A cross sectional study

12 18 1 24-11-2024

Đánh giá đáp ứng hóa trị bước 2 phác đồ FOLFIRI – BEVACIZUMAB trên bệnh nhân ung thư đại trực tràng di căn tại Bệnh viện Ung bướu Đà Nẵng

6 16 1 24-11-2024

A clustered randomized control trial to assess feasibility, acceptability, and impact of implementing the birth companion intervention package in Ethiopia, Kenya, and Nigeria: Study protocol

11 16 1 24-11-2024

Giá trị của tư tưởng Hồ Chí Minh về chủ nghĩa xã hội trong giai đoạn hiện nay

12 17 1 24-11-2024

Adverse drug reactions in hospitals: Population estimates for Portugal and the ICD-9-CM to ICD-10-CM crosswalk

9 20 1 24-11-2024

A resilient workforce: Patient safety and the workforce response to a cyber-attack on the ICT systems of the national health service in Ireland

9 17 1 24-11-2024

What are the experiences of team members involved in root cause analysis? A qualitative study

8 16 1 24-11-2024

Exploring patient perspectives on how they can and should be engaged in the development of artificial intelligence (AI) applications in health care

14 18 1 24-11-2024

Essential health services delivery and quality improvement actions under drought and food insecurity emergency in north-east Uganda

12 17 1 24-11-2024

Ibrutinib versus bendamustine plus rituximab for first-line treatment of 65 or older patients with untreated chronic lymphocytic leukemia without del(17p)/TP53 mutation in China: A lifetime economic research study

11 25 1 24-11-2024

Quyền riêng tư đối với dữ liệu cá nhân trên không gian mạng theo pháp luật của Liên minh châu Âu - Một số kinh nghiệm cho Việt Nam

13 18 1 24-11-2024

Patient-clinician digital health interventions for the hip fracture population: A scoping review

36 17 1 24-11-2024

Olympic Cơ học toàn quốc lần thứ 34 (Năm 2024)

161 31 1 24-11-2024

Ebook High voltage engineering - Theory and practice: Part 2

336 15 1 24-11-2024

Assessing implementation fidelity of an onsite pharmacist intervention within Australian residential aged care facilities: A mixed methods study

12 16 1 24-11-2024

Đánh giá mức độ nhiễm khuẩn và kiểm tra tính đề kháng kháng sinh của vi khuẩn gây bệnh phân lập được từ microphone - dụng cụ hỗ trợ dạy học tại một số trường Đại học tại Tp. HCM

6 15 1 24-11-2024

Fight against crime facing the challenge of digital economic transformation

9 16 1 24-11-2024

Estimated indirect costs of haemodialysis versus peritoneal dialysis from a patients’ perspective at an Academic Hospital in Pretoria, South Africa

8 20 1 24-11-2024

Socioecological systems analysis of potential factors for cholera outbreaks and assessment of health system’s readiness to detect and respond in Ilemela and Nkasi districts, Tanzania

10 20 1 24-11-2024

TÀI LIỆU HOT

Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”

3 25311 252

Thiết kế kế hoạch bài học môn Toán theo định hướng phát triển năng lực học sinh

13 41410 2437

CẬP NHẬT KINH TẾ VĨ MÔ VIỆT NAM 6 tháng đầu năm 2020

3 3094 81

Sách trắng Doanh nghiệp Việt Nam năm 2020

580 5439 365

Việt Nam 2035 hướng tới thịnh vượng, sáng tạo, công bằng và dân chủ

584 3649 101

BÀI GIẢNG DỰNG HÌNH SKETCHUP 2020 BIÊN SOẠN : GV.KTS PHAN THỨC

62 7038 1

GIÁO TRÌNH TIẾNG ANH ENG BREAKING

171 6017 724

Quản trị khủng hoảng trong quan hệ công chúng

2 3492 78

Báo cáo thực tập chuyên ngành: Nghiên cứu, thiết kế, mô phỏng robot công nghiệp

51 4785 200

Đề tài “ Cân đối ngân sách nhà nước- thực trạng và hướng hoàn thiện”

53 5091 189