Bước đầu xây dựng phương pháp luận hỗ trợ định danh các mẫu nấm Cordyceps và các chi lân cận bằng phát sinh chủng loài phân tử đa gen

Chi nấm ký sinh côn trùng Cordyceps (họ Clavicipitaceae), tiêu biểu có Cordyceps sinensis, chứa nhiều thành phần hoạt chất quan trọng và nhiều ứng dụng trong y học. Bài viết tiến hành xây dựng một phương pháp luận dựa trên sinh học phân tử kết hợp tin sinh học để định danh các mẫu nấm kí sinh côn trùng tại Langbian nói chung và Việt Nam nói riêng. | Bản tin Khoa học Trẻ số 2 1 2016 1 BƯỚC ĐẦU XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP LUẬN HỖ TRỢ ĐỊNH DANH CÁC MẪU NẤM CORDYCEPS VÀ CÁC CHI LÂN CẬN BẰNG PHÁT SINH CHỦNG LOÀI PHÂN TỬ ĐA GEN ON THE FIRST STEPS TOWARDS A METHODOLOGY TO ASSIST IN THE IDENTIFICATION OF CORDYCEPS AND RELATED FUNGI BY MULTIGENE PHYLOGENETICS Trịnh Văn Hạnh Ngô Thị Diệp Nguyễn Thị Bích Thảo Nguyễn Thị Thu Thảo Lao Đức Thuận Khoa Công nghệ Sinh học trường Đại Học Mở TP. Hồ Chí Minh SUMMARY A methodology was created to assist in the identification process of entomopathogenic fungi Cordyceps Clavicipitaceae a genus with a diverse species content and therapeutic applications. The method was formed from creating a reference dataset to assist in the identification process of several samples. 1 The dataset includes database of nrSSU nrLSU Tef1 Rpb1 Tub and Atp6 for related fungi 2 Gene sequences obtained from fungal samples of Lang Bian Lam Dong through DNA extraction by phenol chloroform method with the assist of β-mercaptoethanol and CTAB 3 Molecular phylogenies were analyzed on single gene and multigene trees by MEGA software with different tree construction methods Neighbor Joining NJ Maximum Parsimony MP and Maximum Likelihood ML . Boostrapping was included to support tree branches. The molecular method with the combination of molecular biology and bioinformatics was completely in agreement with morphological-based methods. As a result DL0038A and DL0038B were reconfirmed as Cordyceps takaomontana Anamorphic form Isaria tenuipes DL004 was reconfirmed asCordyceps was in a very close relationship or is Isaria. tenuipes DL0075 was in a very close relationship or is Cordyceps. staphylinicola. DL0069 and DL0077 were in a very close relationship with Simplicillium lamellicola or Simplicillium lanosoniveum. Keywords Molecular phylogenetics Cordyceps Clavicipitaceae Entomopathogenic fungi. MỞ ĐẦU Chi nấm ký sinh côn trùng Cordyceps họ với chi nấm này do 1 sự đa dạng về đặc Clavicipitaceae tiêu .