Có nhiều phương pháp khác nhau có thể được sử dụng để phân tích ADN và ARN, nhưng cho đến nay điện di trên gel là phương pháp được sử dụng phổ biến hơn cả nhờ ưu điểm nhanh và tương đối đơn giản. | Điện di phân tích ADN va ARN Có nhiều phương pháp khác nhau có thể được sử dụng để phân tích ADN và ARN nhưng cho đến nay điện di trên gel là phương pháp được sử dụng phổ biến hơn cả nhờ ưu điểm nhanh và tương đối đơn giản. Nguyên tắc của phương pháp là do dưới tác động của điện trường các phân tử ADN thường tích điện âm khác nhau về kích thước điện tích mức độ cuộn xoắn và dạng phân tử mạch thẳng hay mạch vòng sẽ di chuyển qua hệ mạng của gel từ cực âm cathode sang cực dương anode với tốc độ di chuyển khác nhau. Vì vậy chúng dần dẩn tách nhau ra trên trường điện di qua đó người ta có thể thu thập và phân tích được từng phân đoạn ADN hoặc gen riêng rẽ. Trên điện trường các phân đoạn ADN có kích thước càng nhỏ càng có tốc độ di chuyển trên điện trường nhanh hơn. Sau khi điện di kết thúc các phân tử ADN có thể quan sát thấy nhờ sử dụng các thuốc nhuộm phát huỳnh quang chẳng hạn như ethidium chất này gắn kết với ADN bằng cách cài vào khe ở giữa các nucleotit . Mỗi một băng điện di thường phản ánh một tập hợp các phân tử ADN có cùng kích thước. Có hai loại vật liệu làm gel được sử dụng phổ biến trong điện di đó là agarose và polyacrylamid. Trong đó gel polyacrylamid có khả năng phân tách cao nhưng khoảng kích thước ADN có thể phân tích hẹp. Vì vậy điện di trên gel polyacrylamid có thể phân tách được các phân đoạn ADN khác nhau thậm trí chỉ một cặp nucleotit 1 bp duy nhất nhưng thường chỉ để phân tích các đoạn ADN kích thước vài trăm bp. Còn gel agarose có khả năng phân tách thấp hơn đối với các phân đoạn ADN kích thước nhỏ nhưng rất hiệu quả khi phân tách các phân đoạn ADN kích thước lớn tới hàng chục hoặc hàng trăm kb 1 kb 1000 bp . Các phân đoạn ADN kích thước lớn không thể lọt qua các lỗ có kích thước nhỏ trên các bản gel kể cả gel .
