Các đoạn ADN có trình tự xác định kích thước ngắn được sử dụng nhiều trong các nghiên cứu khác nhau của di truyền học phân tử, chẳng hạn như sử dụng làm mồi trong các phản ứng PCR, hay dùng làm mẫu dò trong các phương pháp lai phân tử. | Tống hợp hóa học và sử dụng các đoạn oligonucleotit Các đoạn ADN có trình tự xác định kích thước ngắn được sử dụng nhiều trong các nghiên cứu khác nhau của di truyền học phân tử chẳng hạn như sử dụng làm mồi trong các phản ứng PCR hay dùng làm mẫu dò trong các phương pháp lai phân tử. Các đoạn trình tự này thường được tổng hợp theo phương pháp hóa học và được gọi là các đoạn oligonucleotit. Phương pháp hóa học được sử dụng phổ biến nhất được tiến hành trên bề mặt cứng sử dụng máy tự động. Tiền chất để tạo nên các nucleotit lần lượt gắn với đoạn oligonucleotit theo trật tự nhất định được gọi là các hợp chất phosphoamidine xem hình minh họ a . Phản ứng kéo dài chuỗi oligonucleotit diễn ra bằng việc gắn thêm tiền chất nucleotit mới vào phía đầu 5 như vậy ngược chiều với phản ứng kéo dài chuỗi ADN sử dụng enzym ADN polymerase. B hjrtiraxyi btarhít by dmcllw yViM fOMT Phương pháp tổng hợp hóa học có hiệu quả và độ chính xác cao khi tiến hành tổng hợp các phân tử ADN mạch đơn có độ dài tới 30 nucleotit. Với các thiết bị tổng hợp oligonucleotit hiện nay một người nghiên cứu có thể dễ dàng tổng hợp bất cứ một trình tự ADN ngắn nào đơn giản bằng cách gõ và nhập trình tự nucleotit mong muốn vào phần mềm máy tính điều khiển máy tổng hợp tự động. Tuy vậy khi phân tử ADN được tổng hợp có kích thước lớn thì độ chính xác của trình tự và độ đồng đều của sản phẩm tạo thành giảm đi do các lỗi cố hữu mang tính kỹ thuật. Thực tế các phân tử ADN có trình tự dài hơn 100 nucleotit khó có thể được tổng hợp bằng các phương pháp hóa học mà đảm bảo được số lượng và chất lượng mong muốn. Các đoạn oligonucleotit kích thước ngắn ngoài các ứng dụng làm mồi phản ứng PCR hay làm mẫu dò như được nêu ở trên còn có thể được sử dụng cho .
