Sự tiến hóa bao gồm cả chọn lọc tự nhiên của Darwin và đột biến gen ở mức độ loài được rộng rãi các nhà khoa học thừa nhận. Tuy nhiên, cho đến nay cũng chưa có sự thống nhất về cơ chế của nó | Sự tiến hóa của sinh vật Sự tiến hóa bao gồm cả chọn lọc tự nhiên của Darwin và đột biến gen ở mức độ loài được rộng rãi các nhà khoa học thừa nhận. Tuy nhiên cho đến nay cũng chưa có sự thống nhất về cơ chế của nó đặc biệt vai trò tương đối nào của 3 cơ chế chủ yếu chọn lọc đột biến và tính ngẫu nhiên vai trò nào của sự chọn lọc ở các mức tổ chức sinh học cao đồng tiến hóa và sự chọn lọc nhóm . Từ thời Darwin nói chung các nhà sinh học đã cho rằng sự tiến hóa là một quá trình chậm chạp diễn ra từ từ kể cả những đột biến nhỏ và sự chọn lọc tự nhiên liên tục nhằm đảm bảo tính ưu thế trong cạnh tranh ở mức độ loài. Song vấn đề trong biên niên sử cổ phát sinh chủng loại không tìm được các dạng trung gian buộc những nhà nghiên cứu cổ phát sinh phải công nhận thuyết cân bằng gián đoạn . Theo lý thuyết này trong một thời kỳ dài các loài không biến đổi về trạng thái nguồn gốc của mình trong tiến hóa cân bằng. Theo thời gian cân bằng này bị đứt đoạn khi đó quần thể nhỏ sẽ tách khỏi loài gốc và nhanh chóng phát triển thành loài mới nhưng lúc này về mặt cổ phát sinh chủng loại lại không tìm được những dạng chuyển tiếp. Loài mới có the rất khác loài gốc. Điều đó cho phép chúng có thể chung sống với nhau không cạnh tranh chèn ép nhau hoặc có thể không chung sống hoặc cả hai đều bị chết. Học thuyết tiến hóa gián đoạn không chỉ ra được vai trò cạnh tranh loại trừ ở mức cá thể cũng như động lực của quá trình. Đến nay cũng chưa rõ yếu tố nào có thể là nguyên nhân phân chia quần thể một cách đột ngột để tạo nên một đơn vị mới loài mới cách ly về di truyền. Các loài sống trong những vùng địa lý khác nhau hoặc bị ngăn cách bởi chướng ngại không gian được gọi là loài khác vùng phân bố Allopatric hay còn gọi là loài dị hình. Nếu những .