Một câu hỏi thường được đặt ra cho các nhà nghiên cứu phân tích dữ liệu bộ gene là khi thực hiện lọat thí nghiệm microarray trong đó hoạt tính của các protein điều hoà theo dạng cis luôn thay thì liệu có thể dự đoán được các mô thức gắn kết giữa các protein này và DNA vùng thượng nguồn của các gene đang chịu sự điều hoà của chính các protein này hay không? | Dò tìm mô thức găn DNA của các nhân tố điều hòa phiên mã thông qua dữ liệu genome Một câu hỏi thường được đặt ra cho các nhà nghiên cứu phân tích dữ liệu bộ gene là khi thực hiện lọat thí nghiệm microarray trong đó hoạt tính của các protein điều hoà theo dạng cis luôn thay thì liệu có thể dự đoán được các mô thức gắn kết giữa các protein này và DNA vùng thượng nguồn của các gene đang chịu sự điều hoà của chính các protein này hay không Một bài bào công bố trên tạp chí Microbiology 151 31973213 2005 mô tả một nghiên cứu chuyên sâu về nội dung này. Trong một kỉ nguyên mà những dữ liệu đồ sộ về gene và chức năng của genome đang được tạo ra hàng ngày một thách thức cho các nhà sinh học là phải phát triển những kĩ thuật cho phép trích xuất các thông tin hữu dụng mà từ đó có thể cung cấp các tin tức và hướng dẫn các nghiên cứu thực nghiệm xa hơn. Trong nghiên cứu này Haluk Reasat và các đồng sự đã tập trung trên bộ gene của vi khuẩn quang hợp Rhodobacter sphaeroides nhằm tìm kiếm mô thức DNA mà ba nhân tố điều .
