Cơ thể thực vật cũng như động vật có hệ thống tự bảo vệ riêng (hệ miễn dịch) để chống lại sự xâm nhập và phát triển của các vi sinh vật có hại như virus, vi khuẩn, nấm, nguyên sinh vật. Xét ở mức độ tế bào và phân tử, tương tác giữa thực vật và vi sinh vật gây bệnh là cuộc chạy đua song song về mặt thời gian:[1] vi sinh vật bám lên bề mặt tế bào, | Vài nét về miễn dịch thực vật Cơ thể thực vật cũng như động vật có hệ thống tự bảo vệ riêng hệ miễn dịch để chống lại sự xâm nhập và phát triển của các vi sinh vật có hại như virus vi khuẩn nấm nguyên sinh vật. Xét ở mức độ tế bào và phân tử tương tác giữa thực vật và vi sinh vật gây bệnh là cuộc chạy đua song song về mặt thời gian 1 vi sinh vật bám lên bề mặt tế bào sau đó xâm nhập vào tế bào thực vật . 2 tế bào thực vật có các thụ thể nhận biết các phân tử hợp chất đặc trưng cho sự có mặt của vi sinh vật sau đó phát động các cơ chế bảo vệ chống lại sự xâm nhập và phát triển lây lan của vi sinh vật. Nếu các cơ chế này được phát động sớm và hiệu quả sẽ ngăn chặn sự phát triển của vi sinh vật vì thể cây trồng sẽ không bị nhiễm bệnh trường hợp ngược lại vi sinh vật sẽ xâm chiếm lan rộng và tiêu diệt từ tế bào đến cả cơ thể thực vật. Câu hỏi đầu tiên đặt ra là vi sinh vật xâm nhập vào cây trồng như thế nào Có ba con đường chủ yếu qua các lỗ mở tự nhiên qua các vết thương vêt trầy xước trên cây và do chính vi sinh vật tự có cơ chế đe xuyên thủng tầng cutin cellulose vào tế bào thực vật. Rất nhiều vi sinh vật xâm nhập vào cây chủ qua lỗ khí khí khổng qua các lỗ mở trên hoa hay xâm nhập vào hạt phấn hạt phấn thụ tinh sẽ đem theo cả vi sinh vật vào hợp tử mới . Một số vi sinh vật như nấm bệnh Magnaporthe grisea hay Botrytis cinerea sử dụng cơ chế riêng với appressorium đe xuyên thủng lớp bảo vệ cutin cellulose đe xâm nhập vào tế bào .
