Mở đầu : Những vi sinh vật có khả năng sinh methane (mêtan), mẫn cảm với oxygen và có cấu trúc màng tế bào đặc biệt đã được biết đến từ lâu nhưng mãi đến cuối những năm 1970 chúng mới được nhìn nhận như đại diện của một dạng sống thứ ba trên trái đất bên cạnh vi khuẩn và sinh vật nhân thật, đó là cổ khuẩn. Carl R. Woese và cộng sự (1977) sau khi xem xét trình tự 16S rARN nhận thấy rằng các sinh vật nhân nguyên thuỷ (Prokaryote) cần được chia thành hai nhóm. | Các nhóm vi khuân chủ yêu Cô khuân Archaea A 4-A Mở đâu Những vi sinh vật có khả năng sinh methane mêtan mẫn cảm với oxygen và có cấu trúc màng tế bào đặc biệt đã được biết đến từ lâu nhưng mãi đến cuối những năm 1970 chúng mới được nhìn nhận như đại diện của một dạng sống thứ ba trên trái đất bên cạnh vi khuẩn và sinh vật nhân thật đó là co khuẩn. Carl R. Woese và cộng sự 1977 sau khi xem xét trình tự 16S rARN nhận thấy rằng các sinh vật nhân nguyên thuỷ Prokaryote cần được chia thành hai nhóm khác biệt nhau hoàn toàn là Vi khuẩn Eubacteria hay Bacteria và Co khuẩn Archaeabacteria hay Archaea và cùng với các Sinh vật nhân thật Eukarya làm thành ba lĩnh giới Domains ở sinh vật Hình 1 . Các nghiên cứu sâu hơn về phả hệ và đặc điêm sinh lý sinh hoá cho thấy rằng co khuẩn được tách ra từ rất sớm trong quá trình tiến hoá chúng không gần vi khuẩn nhiều hơn so với sinh vật nhân thật do vậy tên gọi Archaea được đề xuất thay cho Archaeabacteria. Hiện nay cả hai tên gọi Archaea và Archaeabacteria đ ều được sử dụng trong các tài liệu vi sinh vật tuy nhiên thuật ngữ Archaea chính xác hơn vì rõ ràng cổ khuẩn không phải vi khuẩn mà là một nhóm vi sinh vật riêng .