Ngay cả khi bạn thường xuyên xóa file không cần thiết và quản lý tốt các file trên ổ cứng, bạn vẫn sẽ thấy truy cập ổ cứng cứ chậm dần theo thời gian. Một trong những lý do chính là hệ thống file. Với Windows XP, Microsoft khuyến khích người dùng chuyển từ hệ thống file FAT32 sang NTFS.