Một ảnh chỉ số bao gồm một ma trận dữ liệu X và ma trận bản đồ màu map . Ma trận dữ liệu có thể có kiểu thuộc lớp uint8,uint16 hoặc kiểu double . Ma trận bản đồ màu là một mảng mx3 kiểu double bao gồm các giá trị dấu phẩy động nằm giữa 0 và 1 | - Hệ toạ độ không gian này gần tương ứng với hệ toạ độ pixel trong một chừng mực nào đó . Chẳng hạn , toạ độ không gian của điểm gữa của bất kì pixel nào được phân biệt với toạ độ pixel của pixel đó . Cũng có một vài khác biệt , tuy nhiên , trong toạ độ pixel , góc trên trái của một ảnh là (1,1 ) trong khi trong toạ độ không gian , vị trí này mặc định là ( ) . Sự khác nhau này là do hệ toạ độ pixel là rời rạc trong khi toạ độ không gian là liên tục . Cũng vậy , góc trên trái luôn là (1,1 ) trong hệ pixel , nhưng ta có thể chỉ ra một điểm gốc không chính quy cho hệ toạ độ không gian . Một sự khác biệt dễ gây nhầm lẫn nữa là quy ước : thứ tự của các thành phần nằm ngang và thẳng đứng được phục vụ cho kí hiệu của hai hệ thống . Như đã đề cập trước đây , toạ độ pixel được đại diện bởi một cặp (r,c ) trong khi toạ độ không gian được biểu diễn bởi (x,y) . Khi cú pháp cho một hàm sử dụng r và c , nó tham chiếu đến hệ toạ độ pixel . Khi cú pháp sử dụng x, y nó đang ngầm định sử dụng hệ toạ độ không gian .
