Ở một số giáp xác thấp ruột giữa còn có màng lót cuticun bảo vệ ruột như ở Có móc. Ruột sau là một ống thẳng, không có tuyến phụ, một số loài như thuộc giáp xác Bơi nghiêng (Amphipoda) ranh giới giữa ruột giữa và ruột sau có thêm một đôi ống bịt đầu làm nhiệm vụ bài tiết (được gọi là ống malpighi). Ruột của một số loài giáp xác ký sinh như Sacculina tiêu giảm. Hệ tuần hoàn | 158 còn biến protit thành pepton và biến tinh bột thành đường. Ở một số giáp xác thấp ruột giữa còn có màng lót cuticun bảo vệ ruột như ở Có móc. Ruột sau là một ống thẳng không có tuyến phụ một số loài như thuộc giáp xác Bơi nghiêng Amphipoda ranh giới giữa ruột giữa và ruột sau có thêm một đôi ống bịt đầu làm nhiệm vụ bài tiết được gọi là ống malpighi . Ruột của một số loài giáp xác ký sinh như Sacculina tiêu giảm. Hệ tuần hoàn Có mức độ tổ chức như sơ đồ chung của chân khớp tuy nhiên có mối quan hệ chặt chẽ với sự phát triển của hệ hô hấp. Bộ phận chủ yếu là một ống lưng có phần phình có khả năng co bóp được gọi là tim. Tim có lỗ tim và xoang tim. Máu sau khi chảy ra khỏi tim thì chảy vào trong các xoang hở ở các nội quan của cơ thể hệ tuần hoàn hở . Ở giáp xác thấp thì hệ tuần hoàn kém phát triển. Ví dụ như ở giống Daphnia không có mang chỉ có tim bộ Copepoda không có hệ tuần hoàn. Ở giáp xác cao hệ tuần hoàn phát triển nhất là bọn Mười chân Decapoda . Tim của chúng hình ống hay hình túi nằm ở mặt lưng có xoang bao tim đây là phần còn lại của thể xoang. Ngoài ra còn có hệ mạch máu phức tạp chuyển máu từ tim về các cơ quan của cơ thể về mang rồi từ mang theo khe hổng về xoang bao tim. Máu giáp xác có thể đông ở giáp xác cao thì có sắc tố hemocyanin có nhân kim loại là đồng Cu còn ở giáp xác thấp thì chứa hemoglobin có nhân sắt Fe hình . Hệ bài tiết Là sự biến đổi của hậu đơn thận được gọi là tuyến râu và tuyến hàm lỗ bài tiết đổ ra ở gốc râu hay gốc hàm dưới. Ở giai đoạn ấu trùng thì có cả 2 loại tuyến còn giai đoạn trưởng thành có thể thay đổi. Ví dụ như ở giáp xác Nebalia và Cypridina ở giai đoạn trưởng thành có cả tuyến râu và tuyến hàm. Nhóm Chân mang tuyến râu hoạt động ở giai đoạn ấu trùng còn tuyến hàm lại hoạt động ở giai đoạn trưởng thành. Giáp xác cao thì trưởng thành chỉ có tuyến râu. Mỗi tuyến cơ bản gồm một túi thể xoang và một ống dẫn tuy nhiên có thể phân hoá phức tạp như ở nhóm Mười chân có khúc cuộn có bóng đái có phễu thận. . .
