Như đã nói, cơ sở phương pháp luận của dự án Toàn tập là sự bảo đảm tính đầy đủ (tức là sự hiện diện tất cả các văn bản của nhà văn được biết cho đến thời điểm này, không cắt xén), sự cải tiến công tác chuẩn bị văn bản và chú giải khoa học, sự tham khảo kinh nghiệm của khoa Gogol học thế giới được xem xét từ lập trường hàn lâm, chứ không phải ý thức hệ | về bộ toàn tập kiểu hàn lâm mới của Gogol Như đã nói cơ sở phương pháp luận của dự án Toàn tập là sự bảo đảm tính đầy đủ tức là sự hiện diện tất cả các văn bản của nhà văn được biết cho đến thời điểm này không cắt xén sự cải tiến công tác chuẩn bị văn bản và chú giải khoa học sự tham khảo kinh nghiệm của khoa Gogol học thế giới được xem xét từ lập trường hàn lâm chứ không phải ý thức hệ. Mỗi một thành tố của phương pháp luận này là một nhiệm vụ khoa học thiết thực thể hiện một giai đoạn mới mang tính quy luật trong việc nghiên cứu sáng tác Gogol và xuất bản nó ở Nga. Cũng như trong mọi bộ toàn tập kiểu hàn lâm công tác quan trọng hàng đầu là chuẩn bị văn bản các tác phẩm. Ở đây những người biên soạn vấp phải một số khó khăn đặc thù. Như ta biết Gogol sinh thời chưa kịp chuẩn bị một bộ toàn tập hay tổng tập tác phẩm nào của mình. Hơn thế nữa do điều kiện sống nhiều năm ở nước ngoài ông đã ủy nhiệm cho một người bạn thân - . Prokopovich - ấn hành một số tác phẩm của ông và Prokopovich đã đưa vào các văn bản của Gogol thường được người khác chép lại không ít sửa chữa cả về chính tả ngữ pháp lẫn văn phong. Những sửa chữa văn phong ấy đã được phát hiện và loại bỏ trong nhiều lần xuất bản các tổng tập và toàn tập Gogol trước đây nhưng công việc này chưa được làm triệt để theo một hệ phương pháp thống nhất với sự sử dụng tất cả các cứ liệu văn bản học hiện có các thủ bản của tác giả các bản sao đã được tác giả xem lại các bản in thử được tác giả sửa . Những nguyên tắc và tiêu chí được xây dựng để giải quyết các vấn đề văn bản học trong lần xuất bản Toàn tập này là như sau những tác phẩm nào được chính Gogol chuẩn bị văn bản để xuất bản thì in lại theo văn bản đã được tác giả chuẩn bị những tác phẩm nào mà văn bản đưa in được người khác chuẩn bị thì in lại hoặc theo thủ bản cuối cùng của tác giả nếu còn giữ được hoặc bằng nghiên cứu văn bản học thiết lập những tác bản loại trừ tối đa những sự can thiệp của người khác những tác phẩm nào chưa được in hoặc chưa được in